农产品普票可以抵扣的税是增值税。
详细解释如下：
一、农产品普票与增值税抵扣
农产品普票，即农产品普通发票，是购买农产品时由销售方开具的发票。在增值税税制下，购买方可以通过普票上的信息来抵扣相应的增值税。这种抵扣机制有助于减轻企业的税收负担，鼓励农产品的流通与消费。
二、增值税抵扣的具体操作
在购进农产品时，企业会获得普票作为凭证。根据普票上的税额，购买方可以在申报纳税时进行相应的抵扣。这种抵扣操作需要符合税务部门的相关规定，例如抵扣比例、抵扣条件等，以确保操作的合法性和准确性。
三、农产品增值税抵扣的意义
农产品增值税抵扣政策的实施，有助于农业产业的发展。一方面，它可以降低农产品流通环节的税收负担，促进农产品的销售；另一方面，也能鼓励企业加大农产品采购力度，推动农业生产的规模化、产业化。同时，对于购买方而言，抵扣机制也降低了其采购成本，提高了企业的竞争力。
四、注意事项
在进行农产品普票抵扣时，企业应确保普票的真实性、合法性和有效性。同时，还需注意税务部门的相关规定，确保抵扣操作符合政策要求，避免违规操作带来的风险。
总之，农产品普票主要可以抵扣的税种是增值税，企业在操作过程中应严格遵守相关规定，确保税收抵扣的合法性和准确性。