芒康县平均海拔4317米。芒康县位于西藏自治区东南部，昌都市的最东部，地处川、滇、藏三省区交会处。东与四川省甘孜藏族自治州巴塘县，南与云南省迪庆藏族自治州德钦县毗邻，西与左贡县接壤，北与贡觉县、察雅县相接。
芒康藏语意为“善妙地域”，芒康县总面积1.16万平方公里。截至2021年查询，芒康县辖2个镇、14个乡（包括1个民族乡）：嘎托镇、如美镇、曲孜卡乡、木许乡、盐井纳西民族乡、朱巴龙乡、曲登乡、徐中乡、帮达乡、戈波乡、洛尼乡、措瓦乡、昂多乡、宗西乡、莽岭乡、索多西乡。芒康县人民政府驻嘎托镇（该数据为2014年统计）。