红河州州府在蒙自市。
1950年1月16日，蒙自解放，蒙自县人民政府隶蒙自专区，专区行政公署驻蒙自。
1957年11月，蒙自专区与红河哈尼族自治区（驻地在今元阳县）合并成立红河哈尼族彝族自治州，州府驻蒙自。
1958年7月，红河州人民委员会由蒙自县迁往个旧市。
1958年10月20日，国务院全体会议第81次会议决定：撤销蒙自县，将原蒙自县全部地区划归个旧市。
1960年9月13日，国务院全体会议第103次会议通过：恢复原并入个旧并撤销的蒙自建制，其行政区域仍照原撤并前不变，蒙自由个旧领导。同年，开远草坝公社划归蒙自。
1961年2月14日，国务院批复：将原来由个旧领导的蒙自划归红河哈尼族彝族自治州直接领导。
2003年1月29日，国务院批复：红河哈尼族彝族自治州人民政府驻地由个旧市迁移至蒙自县。
2010年9月10日，经国务院批准，民政部批复：撤销蒙自县，设立蒙自市。
蒙自市位于云南省东南部，红河州东部。东邻文山市，南接屏边苗族自治县，西连个旧市，北与开远市接壤。北回归线从境内鸣鹫镇小坝心、西北勒乡苏租、文澜镇大台子、雨过铺镇新光、长桥海东坝穿过。
蒙自市主要地形为山区和坝区，其中山区面积占总面积的75.6%；坝区面积占总面积的24.4%，县城海拔1307米。
蒙自市地处云南低纬高原，属亚热带季风气候类型，年平均气温18.6℃，极端最高气温33.8℃，极端最低气温2.9℃无霜期337天，年降雨量815.8毫米，年均日照时数2234小时。