楼主你好，你所指的《包青天》是金超群版的吧
金超群版的《包青天》不分“部”，是按“单元”划分的。就按楼主所说，41个故事，其实就是41个单元。
如果真要按“部”来分的话，那么也只能从拍摄时间来说话了。比如百科资料中金超群版的包青天分三段拍摄，即：1993版、1995版、2008版。我们可以从这个方向将其看成三部。
PS：楼主所说的41个故事都是1993版的。另外，楼上的朋友，你这是答非所问呀
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呵呵，楼主又补充了说明呀
第一，先从楼主的“比如”说话
真假状元、狸猫换太子、双钉记不包括在铡美案中，因为这几个故事并不关联。而后面的1－6、7－11、12－18、9－21，这只是按总的剧集依次往下排列的单集数字。
第二，还有一种情况，就是几个故事有联系。但这也只说明单元与单元之间的故事情节联系，并不存在这个单元包含那个单元。各个单元是平行的同等地位的，不存在包含关系。
第三，还是我前面所说：如果真要按“部”来分的话，那么也只能从拍摄时间来说话了。比如百科资料中金超群版的包青天分三段拍摄，即：1993版、1995版、2008版。我们可以从这个方向将其看成三部。
PS：楼主能看明白吧
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呵呵，楼主你能保证仅仅是碟子上的封面所说就一定是权威的吗？
即便是正版碟子，我们也不能全信封面上的信息，因为这只是碟片制作商的一种包装。要看权威内容还得查找百科或者官方网站。
这里我要声明：我以上所说也仅是个人观点，但并非纯主观的，而是参考了许多资料的客观分析。我并没有将个人观点强加他人的意思，也仅仅是说出来供楼主参考。我希望我以上所说对楼主会有所帮助！
温馨提示：答案为网友推荐，仅供参考