通过低温处理的芹菜种子，如果夏季不加任何保护，仍然会遭到高温、强光、猛雨的危害，轻者出苗不齐，推迟出苗；重者暴雨会把种子冲跑。因此6月中旬至8月中旬播种的芹菜种子一定要进行保护，具体来说就是在畦面上搭棚遮阳防雨。比较省事的办法是利用大棚、拱棚、温室骨架上覆盖遮阳网。
播种时，要施足腐熟的底肥。如果肥料不腐熟施入土中易起热，会影响出苗。另外因芹菜种子小，幼苗顶土力弱，所以畦地要求土碎、畦平。因为芹菜苗床要经常拔草间苗，所以畦不能太宽，一般畦宽120厘米，以便于工作。
播种时一般采用已低温处理催过芽的种子，并且有一些已经出芽，所以要采用“盖种法”，即在整平的畦内先浇透水，待畦面无“明水”再撒籽，并及时用近畦内的过筛细土撒一层，一般以0.1～0.2厘米为宜，“遮住身”即可，因为微弱的散射光利于种子发芽出苗。另外芹菜种子特别小，又是双子叶，覆土稍厚就会影响出苗。覆土后在畦面架设遮阳棚。
遮阳网以透光率50%左右的黑色或灰色为好。如果没有遮阳网也可用旧薄膜代替。在畦面顶部的拱架上覆以旧膜，四周要卷起30～40厘米，便于通风换气。实践证明，这种“只盖天不盖地”的覆盖薄膜方法，由于使用的是透光性差的旧膜，畦面光强比露地低50%～60%，畦内呈一种弱光环境，温度比露地低2～3℃，雨淋不着，风吹不着，畦内形成一个较为稳定的生长环境，有利出苗和幼苗的生长。
夏播芹菜遮阳方法很多，有的在畦面上用竹竿搭成平棚，上覆盖稻草把、杂草或带叶的树枝；有的用带叶的树枝交叉插在畦埂上。这些方法虽都有一些效果，但都不理想，也给正常的管理带来许多不便，尤其是对暴雨的防范更显得无能为力。