北京教育考试院是一个重要的教育管理机构，其内部设有多个职能部门，以确保教育考试的顺利进行和管理。以下是其主要的下设机构:
首先，院内的核心办公部门是办公室，与党办共同办公，负责日常管理和协调工作。人事处则负责处理与员工相关的招聘、培训和考核事宜。财务基建处负责管理考试院的财务和基础设施建设，确保资金使用和设施维护的合理性。
监察处承担着监督和保障考试公正的职责，确保考试过程的公平。院工会则关注员工的福利和权益，致力于构建和谐的工作环境。科研处致力于教育考试的研究与发展，推动考试科学化进程。考务处和信息管理处则负责考试的组织和信息技术支持，确保考试数据的安全和准确性。
考试命题工作由北京教育考试院命题一处和命题二处分别负责，保证考试试题的质量。中等学校招生办公室、普通高等学校招生办公室、研究生招生办公室和成人高等学校招生办公室分别针对不同阶段的教育进行招生管理。高等教育自学考试招生办公室和社会考试办公室则负责各类社会考试的组织工作。
此外，北京教育考试院还有直属单位，如北京市教育考试指导中心，致力于教育考试政策的指导和专业培训；北京高等学校教育科技发展中心专注于教育科技的研发和推广；北京市教育考试招生服务中心提供考试服务支持；北京考试报社负责考试相关资讯的发布；而北京教育考试院本部位于A地址北京市海淀区皂君东里43号西侧和B地址志新东路9号。
北京教育考试院(BJEEA)成立于1996年，隶属于北京市教育委员会，是负责北京地区各级各类教育考试管理和研究工作的专业化机构，同时，承担一些全国教育考试项目。北京教育考试院的主要任务包括：试题命制、考试管理、考试测评及招生录取。建院以来，北京教育考试院将在互惠互利的原则下继续与各国广泛交流，并在理论研究、项目开发、信息技术应用以及考试评价领域寻求全方位的合作。2012年5月北京教育考试院表示依据教育部新修订的内容出台高考新规。