重庆市区作为中国西南的重要交通枢纽，其交通网络发达，包括内河港航、航空、铁路、城市轨道交通、过江公共索道和高速公路等多元化的交通方式。在铁路方面，主城区拥有三大客运火车站：位于渝中区菜园坝的重庆站，渝北区（北部新区）的重庆北站，以及沙坪坝区的沙坪坝站。新建的重庆火车西站作为主要门户枢纽，计划中的综合性铁路特级站，将进一步增强城市的交通实力。
航空交通方面，重庆江北国际机场位于市中心附近，是重庆三大民用机场之一，服务于国内外众多城市和36个国家和地区，是西南航空公司、重庆航空公司等航空公司的基地，同时也是中国西部最繁忙的机场之一，拥有T1/T2航站楼和保税物流设施，是中西部地区航空物流的重要中心。
重庆的轨道交通系统发达，由重庆市轨道交通总公司管理，现有18条线路规划，如地铁和跨座式单轨，已经覆盖主城九区。其中，轻轨二号线是中国西部第一条城市轨道交通线，而重庆地铁一号线、三号线部分路段也已投入运营。过江公交索道是重庆独特的交通方式，如长江索道，全长1598米，运送乘客超过3亿人次。
重庆还有两座跨江公交索道，如长江索道和嘉陵江索道，但后者已停运。重庆由于地形原因，拥有众多巨型桥梁，被誉为“桥都”。例如牛角沱嘉陵江大桥和石板坡长江大桥等，都是连接市区的重要桥梁。
'''重庆市区'''是指重庆自 1937年成为中央直辖市以来，直到 1954年撤销直辖市的20年时间中的重庆市全市行政区域范围，即重庆市民所称的重庆主城9区。