个人所得税房贷抵扣申请方式有两种：
1、房贷抵扣个人所得税的办理可以通过日常由单位发工资时按月预扣。
2、职工可以在次年3月1日至6月30日通过个人所得税APP自行汇算清缴申报办理申请。
扣缴义务人每月或者每次预扣、代扣的税款，应当在次月十五日内缴入国库，并向税务机关报送《个人所得税扣缴申报表》。
个人所得税房贷抵扣标准根据《个人所得税专项附加扣除暂行办法》第十四条：纳税人本人或者配偶单独或者共同使用商业银行或者住房公积金个人住房贷款为本人或者其配偶购买中国境内住房，发生的首套住房贷款利息支出，在实际发生贷款利息的年度，按照每月1000元的标准定额扣除，扣除期限最长不超过240个月。纳税人只能享受一次首套住房贷款的利息扣除。本办法所称首套住房贷款是指购买住房享受首套住房贷款利率的住房贷款。
个人所得税APP申报退税方法1、下载并安装由国家税务总局推出的“个人所得税”APP，并完成身份注册和登录。
2、在APP首页找到并点击进入“专项附加扣除填报”选项。
3、在专项附加扣除页面，选择“住房贷款利息”，确认扣除年度。随后，系统会提示“填报前，您需要提前准备产权证明、贷款合同”，请准备好相关材料，并点击“准备完毕，进入填报”。
4、填写个人基本信息、房贷信息，包括贷款方式、贷款合同编号、贷款期限等。如果房产是夫妻共有，还需要填写配偶信息，并选择扣除比例。一般来说，可以选择100%由自己扣除，或者选择50%与配偶平均扣除。
5、在申报方式填写页面，一般选择“通过扣缴义务人申报”，即由工作单位代为扣缴申报。选择好入职公司后，点击提交即可完成申请。