诊所可以看病，就是你所说的上设备、打针输液；药店只能卖药，没有处方权，不能诊病开药；诊所要到卫生局申请，申请人必须具备执业医师资格（有的地方还要求执业满5年才能申请），只要卫生局批准了，再到药监局备案，就可以了。药店呢，就没必要到卫生局去了，直接去药监局申请，申请人必须具备执业药师资格，对场地和环境还有一些要求，这些旁枝末节药监局会具体要求你怎么做。
现阶段申请诊所和药店都有点困难，有钱还不一定申请得到，还要有人，这就是中国的特殊国情，本人几年前申请诊所时花了半年时间，找了好多人才搞定，现在办什么都难啊!
1、价格不同
各省的各级各类医疗机构有多种购药渠道，其中医院购进的药品，主要以各省市的政府统一招标为主，以政府确定的中标价采购药品。
零售药店可以直接从厂家拿药，也可以在代理商或其他供药商手里拿药。因为拿药环节、中转价差不同，价格就会不一样。
2、报销不同
?去医院开药，需要先挂号，医生看病，根据病情开出合适的药物。需要排队挂号，看病，时间会长一些，比较繁琐一点。如果去药店，可以直接买药，省去一些步骤。
但是医生开药可能会更有针对性，而且大部分药物可以医保报销。而去药店开药，不能报销，有时候不能对症治疗。所以，有人会觉得药房的药物没有这么好的效果。
拓展资料：药店的药比医院贵吗？
对于非国家定价的药品，价格由药店根据经营情况自行制定。有的药店连锁店多，规模比较大，进货时某种药品进得多，价格自然就会便宜一些。小药店药品进得少，价格就高。店面房租高低、优惠活动不同等也会导致价格差异，相邻的两家药店，同一种药的价格都可能不同。”
医院虽存在“以药补医”现象，但仍会执行各省的最高零售价限价，民众不必担心会买到价格严重超标的药品。医院除了提供药品外，还提供各类诊断服务和用药咨询，这是药店所没有的。
由于非国家定价的药品都是由药店自行定价，所以同一种药，药店卖的比医院贵的情况也存在。市民最好根据自己的需要“药比三家”，挑选最适合自己的方式来购买。
法律依据：
《药品经营许可证》药店属于药品零售企业，应符合相应条件取得食品药品监督管理部门核发的；《医疗机构执业许可证》。诊所属于医疗机构，应取得卫生部门核发的
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