郑成功1661年4月28日下令攻城，久攻不下。7月5日，巴达维亚当局根据被郑军水师击败后逃到巴达维亚的通讯船报告的情况，命雅科布·考宇为台湾司令官，统率12艘快艇、货船和725名士兵出发，于8月12日到达台湾海面。郑成功得知此情后，采取围点打援的办法，挫败了荷军的救援，俘、击船多艘，考宇逃回巴达维亚。城中荷军援救无望，粮、药缺乏，疾病传染，战死病亡已达1600余人，仅存700余名官兵，士气低落。1662年1月25日，郑成功下令在乌特利支堡南端建起来的炮台上向城内发射炮弹，荷军乱作一团，最后决定：“一致同意并决定立即写信通知国姓爷，我们愿意和他谈判，在优惠条件下交出城堡。”2月1日，荷兰侵略者终于被迫在投降书上签字。至此，沦为荷属殖民地达38年之久的台湾，又重新回到祖国的怀抱。