主要区别是，科属不同、形态特征不同、生境分布不同，具体如下：
一、科属不同
1、基围虾
基围虾一般指刀额新对虾，俗称沙虾、泥虾，隶属于甲壳纲、十足目、对虾科、新对虾属。
2、南美白对虾
别称凡纳对虾、白肢虾、白对虾、凡纳滨对虾，隶属于甲壳纲、十足目、对虾科、对虾属。
二、形态特征不同
1、基围虾
体色土黄到棕褐色，游泳足棕色或赤色。体表除脊、边缘部分及腹部两侧前下方外，有许多短毛，体表分布许多黑点。额角雄性平直，尖刀形，雌性末端略向上弯。第一步足具座节刺。额角6~9齿，腹部第一至第六节背面具有纵脊，尾节无侧刺，第一步足具座刺，但比基节刺小。
2、南美白对虾
正常体色为青蓝色或浅青灰色，全身不具斑纹。步足常呈白垩状，故有白肢虾之称。头胸甲较短，与腹部的比例约为1:3；额角侧沟短，到胃上刺下方即消失，头胸甲具肝刺及鳃角刺，肝刺明显，第1触角具双鞭，内鞭较外鞭纤细，长度大致相等，但皆短小，腹部第4～6节具背脊，尾节具中央沟，但不具有缘侧刺。
三、生境分布不同
1、基围虾
在我国主要分布于福建、台湾、广东和广西沿海，常栖息于沙泥质或泥沙质底海区，对环境适应能力强，喜潜伏于底质中，适温范围为12~37℃，最适水温为25℃~28℃，高于33℃或低于16℃时，摄食量明显减少。
2、南美白对虾
原产于南美太平洋沿岸的水域，主要分布在美国西部太平洋沿岸热带水域，从墨西哥湾至秘鲁中部都有分布，以厄瓜多尔附近的海域更为集中。自然栖息区为泥质海底，水深0～72米。成虾多生活在离岸较近的沿岸水域，生长的适宜水温为13～40℃，生长的最适温度为23～30℃。水温低于16℃时开始停止摄食。
参考资料来源：百度百科-基围虾
参考资料来源：百度百科-南美白对虾
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