上海到南京火车终点都是中华门的南京火车站。上海出发的话，大部分是上海站（即新客站），少量车是上海南站
最便宜的是3趟绿皮车，票价是24元或28元
上海到南京火车时刻表-上海到南京火车票价查询
序号 车次 始发站-终点站 出发站 出发时间 到达站 到达时间 运行时长 里程 硬座↑ 软座 硬卧下 软卧下
27 1462 上海-北京 上海 11:24 南京 18:32 07时08分 301 24 - 66 -
63 K8482 上海-阜阳 上海 18:31 南京 01:11 06时40分 301 28 - 70 105
84 K8486 上海-阜阳 上海 23:57 南京 03:38 03时41分 301 28 - 70 105
参考资料：http://www.huoche.bit