位于商水县城区健康路东段的商水县卫生局，环境宜人，办公环境优良，设施现代化，已成功晋级为省级卫生先进单位和市级文明单位，正积极争取省级文明单位的荣誉。
全县的医疗卫生体系规模庞大，共有公立医疗机构29家，其中包括县直的7家医疗机构和22个乡镇卫生院。其中，1所为国家二级医院，5家是民营医疗机构，1家为行业医疗机构，而个体诊所的数量更是达到了1300家。
在人才配备方面，卫生系统拥有2378名卫生技术人员，其中包括32名高级职称的专业人士，中级职称人员则有236人。乡村医生队伍庞大，总数超过1900人，为全县的医疗卫生服务提供了坚实的人力保障。
组织结构方面，商水县卫生局作为正科级单位，设有党组。内部设有8个职能股室，分别是：办公室、医政股、人事股、计划财务股、疾病控制股、中医股、妇幼保健和社区卫生股，以及卫生监督股，全面负责各项卫生管理工作。