没有完美的免疫系统，免疫系统只能识别一部分病原。人类和病原共同进化，人类进化获得了抵抗某种病原的能力，但是病原也会变异再次获得感染的能力。
人的免疫系统主要分为物理屏障和由免疫器官与免疫细胞、人体菌群组成的免疫系统。
物理屏障：靠的是呼吸道的粘膜粘住部分病原，人体粘膜分泌粘液，沾了灰尘病原后形成鼻涕和痰；另一个重要的屏障是皮肤，皮肤以物理的方式隔绝了病原进入人体的通道；还有人体的胃肠道，内部有胃酸和肠液等消化性物质，还有肠道菌群等。这两种屏障能够起到一定作用，但是不是万能的，人要吃喝拉撒要呼吸，天然地不断从外界摄入各类危害，当危害超过一定量人体要及时处理也比较麻烦，就可能被病原突破屏障。
人体菌群：人体内外的细菌数量是人体全身细胞数量的十倍以上，它们以人体内外物质为营养，在人体上的分布密度也很高，一旦有了新的病原侵袭，势必要和它们竞争营养，而这种竞争也能限制外来有害菌的侵染。
最后一个是人体免疫系统：免疫系统识别外来的病原靠的是特殊的蛋白糖蛋白，它们相当于形成了一个类似于钥匙孔的构造，一旦外来病原上携带的物质构造能够插入这个钥匙孔，免疫系统才能起作用。这种免疫随着人类的进化不断改变，人类进化至今体内已经融合了大量的病毒基因，使得那些病毒失去了感染人体的能力。然而自然界的病原种类非常多，总有免疫系统无法识别的，那就可能造成人类疾病。
自然界的病原虽然大都很小，但它们毫无疑问也在变异，也就是在不断地进化着，是由于生存竞争导致的生物快速演变。拿非洲的埃博拉病毒来说，埃博拉病毒其实有好几个分型，只有其中一两种具备感染人体的能力，不同的分型就是天然的变异遇到了合适的宿主从而数量暴增成为一种感染动物的新型病毒。
根据病毒的核酸链，有双链、单链DNA病毒，它们的变异性稍差一些，还有RNA病毒，在人体内RNA是承担物质和信息运输的载体，它们很活跃，因此这类病毒的变异性就很强。每年都有流感的传播，而流感正是RNA类型的病毒，变异很快，人体短时间内无法适应，但是从大量的人群来看，又会有一些人天然地具备抵挡这些病毒的免疫系统，这是由于人类不断进化引发的。
所以，结论是人类的免疫系统远远称不上完美，但是人类的免疫系统可以不断进化不断根据环境中存在的病原而改善免疫，这一动态变化的免疫系统又可以说是非常完美的，以不变应万变固然不错，以变对应变化才是更有利的。