上海奉贤经济开发区坐落在上海市西南部，占地面积704.94平方公里，地理位置优越。它北靠黄浦江，南濒杭州湾，拥有13.7千米的江岸线和31.6千米的海岸线，东与南汇区相邻，西与金山区和松江区接壤，北边与闵行区隔江相望，东北方向则是与闵行区浦江镇相连。地理坐标为东经120°27′，北纬30°56′，交通便捷，浦南运河、金汇港等干河流经，公路网络发达，如大亭公路、莘奉公路等，沪杭公路横贯西部，奉浦大桥和轮渡连接两岸。
奉贤的投资环境极具吸引力，作为上海经济发展的核心区域，交通设施日益完善。高速公路如莘奉金、沪洋等贯穿全区，与众多等级公路形成便捷的公路网，平均每平方公里公路密度高达1.1公里。浦东铁路奉贤段和浦东运河等为区域交通提供了便利。邮电通信发达，与上海公共信息服务网和国际互联网连通，遍布全区的能源供应充足，供水系统清澈，污水处理能力强。城市建设方面，新型居住区如江海、曙光等和现代化商住公寓如紫荆、锦绣等不断涌现，公园、绿地和文化设施丰富。
奉贤的交通网络十分发达，公路包括高速公路和城市道路，如A4、A3、A30等，区内还有大叶公路和浦星公路等高等级道路。水运方面，上海国际航运中心和吴淞港距离中心城不远，区内设有2.5万吨级码头。铁路方面，上海新客站和浦东铁路等线路将途径本区，连接多个省份。自然条件方面，奉贤属亚热带季风气候，气候温和，降尘量少，空气质量优良，地势平坦，土壤承载力高，年降雨量适中，无霜期长，平均气温适中，日照充足。
上海奉贤经济开发区（上海国家生物医药产业基地）前身是上海奉贤现代农业园区，成立于2001年，是上海市九大市级开发区之一。园区占地20平方公里，分为生产型服务业功能区和生物医药产业功能区两大板块，北起大叶公路、南至浦南运河、西起S4高速、东至金汇港。2009年分别被国家发改委和国家商务部及科技部列为“上海国家生物产业基地”以及“国家科技兴贸创新基地（生物医药）”，目前落户了上海莱士、上海铭源数康生物芯片、上海海利生物医药、上海本庄生物科技、赛可赛斯药业等生物医药企业。