目前治疗尖锐湿疣药物有西药跟中药两大类。尖锐湿疣症状严重，西药常用的有干扰素，白介素等，这些都是治疗普遍会使用的药物，这些抗毒的药物，一般都只能缓解不适症状，只能作为辅助治疗，不能做为主要的治疗办法，而且长期的药物对肝脏的伤害也是很大的。治疗尖锐湿疣与传统疗法有本质差别，治疗先要通过高精密设备检查，确诊病毒分型，确定病损程度和病变情况，分辨病毒亚型，并将病毒的所有信息储存，然后在治疗启动后进行精确诱导杀灭，同时根据病毒的特性和生理，在基因的操作下，进行接种治疗，并对特殊情况者给予直接的治疗，从而全方位，多层次的保障治疗效果。尖锐湿疣的治疗，难就难在复发。传统的物理治疗仅对肉眼疣体进行治疗，而使用基因工程靶向细胞治疗效应，能对疣体及周围的潜伏感染和亚临床感染起到良好治疗效果，将复发率降至最低。中药虽然副作用小，但是中医一般采用的都是一些中草药，治疗时间长，但是疗效缓慢，对表面的病症可能起到一定的作用，但是对于根本的病毒，肯定也是不能彻底清除的，这样就会造成该病的反复发作。因此治疗尖锐湿疣还是得选择更为先进的技术，这样才能彻底有效的治愈。西药。西药起效比较快，在一定程度上，可缓解或改善尖锐湿疣的不适症状。临床用于治疗尖锐湿疣的西药有很多。但这些药物通常用于临床辅助治疗，对重度的尖锐湿疣患者，尤其是反复发作、久治不愈的患者，所以说光吃药根本就没用。中药。目前通过单纯性服用中药治疗尖锐湿疣较少见，通常仅用于辅助治疗，诸如一些清热解毒的中成药或草药，对临床不适症状的缓解有一定帮助。但是由于疗效不明显、药性不稳定、服用时痛苦大、不能治愈等弊端，临床专家通常不建议采用。治疗尖锐湿疣运用基因工程靶向细胞疗法，该疗法是目前发达国家采用的一种最新抗病毒疗法，提取疣体病变组织进行病毒明确分型，经培养、灭活、减毒、提纯、合成等特殊的处理后进行自体埋殖，从而产生免疫性很强的异体排他性，通过个体共融性原理，通过自体免疫产生针对病毒具有强杀伤力的抗体，结合体内自身免疫细胞产生对病毒的特有的免疫力，使病毒基因彻底逆转，更达到从深层次激活并修复自身免疫细胞活性、彻底消除病毒的目的。
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