保险公司应理赔的。
发生交通事故后，事故双方当事人在认定责任的基础上，通过协商的方式来处理赔偿问题，属于一种合法有效的纠纷解决方式。在双方协商赔偿后，保险公司应该根据事故责任及保险合同的约定进行赔偿。
但是，保险公司应当理赔并不是说保险公司必须按照双方协议的内容来赔偿，保险公司在赔偿时，在按照交警认定的责任的基础上，还需要审查当事人协议赔偿的内容、金额是否合理、是否有合法有效的票据等。如果不符合保险理赔要求的，保险公司可能会对某些项目或金额不予理赔。
所以，作为事故的当事人，应该尽量在交警主持下进行协商，由交警部门协助判断赔偿项目是否可以得到保险公怀的理赔，以减少因保险公司理赔而造成不必要的纠纷和损失。
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