卫所制度是明朝时期的一种军事管理体系，其基本单位是卫，通常由5600名军人组成。每个卫又分为1120人的所，内部设有左、右、中、前、后五个千户所，每个千户所下辖120人的百户所。百户所设有总旗2个，每总旗管理50人，小旗10个，每小旗管理10人。此外，还有两种特殊的千户所，一是守御千户所，直接隶属于都指挥使司，驻扎在特定地点；二是数量较少的“御”军事机构，负责管辖2到3个千户所。
据统计，至洪武二十三年（公元1390年），全国范围内有内外卫547个，所的数量更是达到了2563个，这表明卫所制度在明朝初期已经形成了相对完备的军事组织架构，确保了军事力量的集中管理和区域防御的有序进行。
卫所制为明朝的最主要军事制度，为明太祖所创立，其构想来自於隋唐时代的府兵制。明代在与元朝及元末群雄争战期间，军队的来源，有诸将原有之兵，即所谓从征，有元兵及群雄兵归附的，有获罪而谪发的，而最主要的来源则是籍选，亦即垛集军，是由户籍中抽丁而来。除此之外尚有简拔、投充及收集等方式。此外，明朝中期以後又有强使民为军的方式，不过都属於少数，卫所制仍然是最主要的军制。