中国人与生活在东非的非洲人有关。
具体原因
中科院昆明动物研究所研究员宿兵，在查阅中国现有化石的年代以后，发现了一个不容忽视的断层。这个断层从大约10万年前至4万年前，中国没有任何人类化石出土。经推测，生活于东亚的直立人和早期智人（Homo Sapiens）在最近一次的冰川时期，由于恶劣的气候而绝灭。取而代之的是，从非洲不远万里迁徙而来的现代人种。
但仍有科学家支持“多地区起源说”。中科院古脊椎古人类所的吴新智院士细心比较北京猿人、山顶洞人和现代人的骨骼特征，发现70%的中国人在头骨上有3个特征和北京猿人是一致的。所以，他依旧觉得北京猿人可能是中国人的祖先。但他的学生刘武去非洲考察时，却发现有30%的东非人在这3个头骨特征上也和北京猿人相一致。
1998年，中国科学家意识到DNA遗传密码的重要性。在那些双螺旋的DNA链条上交织着红、黄、蓝、绿4种颜色的小球，A、T、C、G，它们掌管着整个人类的迁徙和发展史。
按科学上的解释，每一个小球就是一个核苷酸单位。所谓基因就是这些小球按照一定秩序连在一起，并具有相应的遗传信息。它有很强的功能性，控制着人类的肤色、形态和健康。比如人类的高血压就有几百个基因在控制。它们的序列不能随便更换。变换了，就要影响身体状况。
而还有些小球的序列不具有功能性，性质如同DNA分子里的填充物。它们的排列是自由的。它们过了几千几百年会自由地发生一次变化，例如原本A的地方出现C。这种变化不受任何外界因素影响，不承担自然选择的压力。它们的改变不会影响身体健康。就是这些遗传突变，记载了人类迁徙的历史信息。
中科院昆明动物研究所研究员褚嘉佑，着重研究的是DNA排列中的一种被称为“微卫星”的特殊排列顺序，这是一种公认的遗传标记。DNA排列中有一种简短的重复，比如TGTGTGTG，其重复的字母和次数都可以遗传，当延续到后代身上时，原先那一个G的位置可能会变成A，或者原先重复9次而到了后代忽然变成重复10次。根据这个原理，褚嘉佑分析了28个东亚人群，推算出在中国的现代人起源时间，不会早于5万年前。
有人认为，褚嘉佑的取样数量太小，没有说服力。2001年，金力的学生柯越海和他的研究小组，对以华人为主的东亚人群进行了大规模的遗传分析。他进入的是Y染色体的世界。它们一代代地由父子相传（可对比：线粒体DNA由母女相传），而且“性格”稳定，一般在几十代之后才会有1到2个基因位点发生变化。这些遗传突变位点的结构如同一棵树，也正是这棵基因树，记录了人类在不同时间向地球不同地点散布的路径。
柯越海共分析12127个男性个体，发现那些Y染色体的YAP、M130和M89上，都会有其中一个位点发生突变。它们是基因树中的3根树枝。它们汇拢到一根叫M168的树根上。这个M168就是非洲人体内的突变位点。也就是说，中国人与生活在东非的非洲人有关。
柯越海说，中国人Y染色体的有效群体本来就不大，所存在的种类不多，这1.2万多个样本，几乎囊括了绝大部分中国人染色体的类型。这可以充分证明，华人占大多数的东亚人群起源于非洲。
10万年前，C和D最先走出非洲，经过了一代又一代人的扩展，来到了印度，接着东继续东进，扩散至亚洲和大洋洲。单倍群C-M130的人群却极可能是最早到达东亚的人群。单倍群C从阿拉伯半岛南部、巴基斯坦、印度、斯里兰卡、东南亚、东亚、大洋洲到美洲都有分布，尤其在远东和大洋洲高频分布，但在撒哈拉以南的非洲没有被发现。C下游的分支，例如C1-M8、C2-M38、C3-M217、C4-M347、C5-M356和C6-P55，都有着区域特异性分布[24]。C3-M217是分布最广的支系，在蒙古和西伯利亚群体中最高频出现。单倍群C1仅在日本人和琉球人中出现，但频率很低，还不足5%。单倍群C2出现在从印度尼西亚东部到波利尼西亚的太平洋岛屿人群，尤其是在波利尼西亚的一些群体中，且由于连续的奠基者效应和遗传漂变而成为了上述地方的特征单倍群。C4几乎仅局限在大洋洲的澳大利亚原住民中。C5在印度及其周边的巴基斯坦和尼泊尔等地低频出现。C6则仅出现在新几内亚高地上。
单倍群D-M174在安达曼尼格利陀人、北部藏缅群体和日本的阿伊努人中高频分布，在其他东亚、东南亚和中亚群体也有低频分布（图1）[17,19,29,30]。D下分D1-M15、D2-M55和D3-P99三个主要支系，还有许多未明确定位的小支系。D1在藏族、羌语支和彝语支人群中广泛分布，在东亚其他群体中也有低频分布[31，32]。D2仅分布于日本，占日本40%以上，是上古绳文人的主要成分。D3在青藏高原东部（康区）、白马人及纳西族等群体中高频 [31]。D*多在安达曼群岛被发现[30]，且已被隔离了至少2万年。其他一些被包含在D*中的小支系也多分布于西藏周边藏缅语人群、东南亚人群，阿尔泰人中也有少量来源不明的D*
5万年前，K-M9中的L-M20(M11)、P-P27(M45)白人分离出去之后，剩余的人群染色体突变为M214，接着又分为N、O。N、O沿着喜马拉雅山南，进入东南亚。4万年前，在东南亚的密林里，N、O演变为黄种人。黄种人逐渐发展壮大了起来，在与CD棕色人种的对比中，渐渐占据了优势，并最终取代了CD棕色人种。也就是说，随着黄种人的到来，Y染色体发生了C、D被O的替换。
单倍群O分为O1、O2和O3三个子类。东亚和东南亚80-90%的人属于O类型，在西伯利亚有一定比例的O1，在中亚有少量O1和一定比例的O3，在西亚有少量O3，在南亚有一定比例的O2和O3，在大洋洲有少量O1、O2和一定比例的O3，O在美洲原住民中基本不存在。
对于O1、O2和O3，除O1-MSY2.2和O3-M122各为一个单倍群外，O2-M268有O2a-PK4、O2b-M176和O2*-M268（XPK4、M176）三个下游单倍群。除以上五个单倍群外，O*-M175(xMSY2.2、M268、M122）构成单倍群O-M175下游的一个剩余单倍群。
◆O1-MSY2.2
广泛分布于西伯利亚、东亚和东南亚，在中亚和大洋洲有少量分布，主要分布于汉族、回族、汉藏语系羌语支人群、南岛语系印度尼西亚语族人群、阿尔泰语系满-通古斯语族人群和部分侗台语系人群。
◆ O2a-PK4
广泛分布于东亚、东南亚和南亚，在大洋洲有少量分布，主要分布于湖南汉族、岭南汉族、孟-高棉语系人群、侗台语系人群和南岛语系印度尼西亚语族人群，于苗瑶语系人群、孟-高棉语系人群。
◆O2b-M176
广泛分布于东亚和东南亚，主要分布于日本人、朝鲜半岛人和印尼人中。◆O2*-M268（XPK4、M176）
广泛分布于东亚大陆，主要分布于汉族。
O*-M175(xMSY2.2、M268、M122
O—M175类型主要分布在东亚、东南亚、北亚东部、部分太平洋岛屿，人口超过15亿，传统黄色人种国家中，O—M175在除外蒙以外的所有东亚黄色人种国家中出现频率都超过了50%，日本为55.2%，韩国为67%。
中国人主体类型就是O—M175，汉族人中超过80%。而且在汉族中O—M175类型中最多的是O3—M122，与周围其他民族并不相同，而与云南地区的许多民族有相似的地方。
