全面深化改革要把握好以下重大关系：
一、领导核心与人民大众的关系。
领导核心与人民大众具有不可分离的内在关联，首先在来源上领导核心产生于人民大众，其次领导核心在历史进程中发挥的独特作用离不开人民大众的支持，再次领导核心所作出的一切贡献最终由全体人民共享。
中国共产党的领导是中国特色社会主义事业最本质的特征和最大优势。建党95年来，中国共产党在革命、建设、改革各个历史时期都发挥了其他政治群体难以替代的作用。人民群众是历史的创造者，也是推动社会发展的决定性力量。
二、深化改革与政治稳定的关系。
全面深化改革是一场深刻革命。推进国家治理体系和治理能力现代化的本质是完善和发展中国特色社会主义制度，这是党和国家的政治原则和政治底线。
政治稳定既是推进治理体系和治理能力现代化的前提条件，也是实现治理体系和治理能力现代化的目标价值之一。对任何一个转型国家而言，必须牢固坚持的头等重要的原则便是保持国家治理体系和治理主体传承的有序、规范和稳定，唯此才能够稳步推进治理能力的现代化。
在全面深化改革的伟大征程中，要把政治稳定作为改革的核心价值予以坚持。
三、国际经验与本国实践的关系。
对人类发展文明成果的自觉吸纳和本国治理体系的自我革新是有效避免改革危机和治理困境的现实路径。实践告诉我们，只有交流互鉴，一种文明才能充满生命力。
中华文明既具有人类发展文明成果的共性，也自带着根深蒂固的文化DNA。在国际交流日益深入的今天，任何国家的改革都不可能是封闭或孤立的，但我们在对待具体的改革措施时，必须考虑到本国的民族特性、历史传统、政治文化、生活习惯和生产力发展水平。
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全面深化改革是一项重大而艰巨的历史任务。改革开放只有进行时没有完成时。
党的十八大以来，新一届党中央承前启后、继往开来，从战略上布局顶层设计，协调推进全面建成小康社会、全面深化改革、全面依法治国和全面从严治党的战略布局，以更加积极的态度和行动推进国家治理体系和治理能力现代化，为下一步更加深入、更具实质性的改革创造了重要条件。
资料来源：人民网：全面深化改革需要处理好哪几大关系
全面深化改革要处理好这些重大关系：解放思想和实事求是的关系、整体推进和重点突破的关系、全局和局部的关系、顶层设计和摸着石头过河的关系、胆子要大和步子要稳的关系、改革发展和稳定的关系。
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第一，处理好解放思想与实事求是的关系。 改革开放的过程，就是解放思想的过程。解放思想不是脱离国情的异想天开，也不是闭门造车的主观想象，更不是毫无章法的莽撞蛮干。解放思想的目的在于更好地实事求是。
第二，处理好整体推进和重点突破的关系。 整体推进又不是平均用力、齐头并进，而是要注重抓主要矛盾和矛盾的主要方面，注重抓重要领域和关键环节。以这些重要领域和关键环节为突破口，可以对全面改革起到牵引和推动作用。
第三，处理好全局和局部的关系。局部与全局相互依存，没有局部就无所谓全局，没有全局局部也不可能存在，既不能以局部代替全局，也不能以全局代替局部。全面深化改革是立足国家整体利益、根本利益、长远利益进行部署的，目的是要达到一加一大于二的效果，产生乘数效应，防止局部利益相互掣肘、相互抵消。
在全面深化改革过程中，每一项改革既要考虑局部的具体情况，更要从大局出发，从全局上来统筹谋划。要避免“只见树木，不见森林”，防止局部和眼前合理却不利于全局和长远的情况发生。
第四，处理好顶层设计和摸着石头过河的关系。 摸着石头过河就是寻找规律，从实践中获得真知，是实践、认识、再实践、再认识。坚持边实践边总结，积累经验后逐步推开，出现问题就及时应对，发现错误就马上纠正，不断从实践中取得规律性认识。回顾我国改革开放的历程，摸着石头过河是具有中国特色、符合中国国情的改革方法，也符合马克思主义认识论和实践论的方法。
同时，随着改革不断推进，必须加强顶层设计和总体规划，提高改革决策的科学性、增强改革措施的协调性。 摸着石头过河和顶层设计是辩证统一的，推进局部的阶段性改革开放要在加强顶层设计的前提下进行，加强顶层设计要在推进局部的阶段性改革开放的基础上来谋划。
第五，处理好胆子要大和步子要稳的关系。坚持胆子要大、步子要稳，战略上要勇于进取，战术上要稳扎稳打。第一位的是拿出全面深化改革的勇气，搞改革不可能都是四平八稳、没有任何风险。只要是经过了充分论证和评估，只要是符合实际、必须做的，该干的要大胆地干。
同时，也要看到，胆子大不是蛮干，必须稳妥审慎，三思而后行。对一些重大改革，不可能毕其功于一役，要稳扎稳打，积小胜为大胜。对改革进程中已经出现和可能出现的问题和困难，要一个一个解决和克服，既敢出招又善于应招，做到蹄疾而步稳。
第六，处理好改革、发展、稳定的关系。 要把改革力度、发展速度和社会可承受程度统一起来，把改善人民生活作为正确处理改革、发展、稳定关系的重要结合点，在保持社会稳定中推进改革和发展，通过改革发展促进社会稳定。
参考资料来源：百度百科-全面深化改革