脱毒蒜种繁殖过程中，常因脱毒不清、虫媒防治不力而致病毒再次感染造成良繁种性退化，甚至混杂，削弱甚至丧失大蒜脱毒复壮之功效。为此，必须采取以下措施进行提纯、复壮。
（1）诱导外植体直接成芽，防止变异
在大蒜脱毒培养过程中，以茎尖为外植体长成的组培苗，主要是通过腋芽进行增殖，所获得的试管苗与通过鳞茎繁殖的对照株无明显差异。通过遗传稳定性检测，未经愈伤组织而直接诱导外植体成芽的可显著降低其变异频率，说明通过腋芽增殖能较好地保持其遗传稳定性。
（2）选优汰劣，选头选瓣
脱毒大蒜后代一般还保持着原品种的生态和形态特征，但长势强旺，株形高大，叶色深绿，蒜头增大。同时，经过多次切割组培，在同一品种内不同株系间存在差异。通过系谱档案的建立，选优汰劣。同时要注意拔除仍带有病毒的植株。若有发现，整个株系圃都要严格检查，甚至要将一个株系内的植株全部拔除。
大蒜收获时要严格选种，选择符合本品种特性的蒜头，单收、单藏。栽蒜时再选瓣，年年进行，可以提高种性。
（3）防止脱毒蒜受病毒再侵染
脱毒蒜在繁殖过程中受病毒再侵染后，同样表现生活力显著降低。所以应采取上述防止病毒再侵染的措施，尽可能地使蒜种无毒。
（4）及时用脱毒原原种更新换代
由于在脱毒蒜扩繁过程中难免会受到病毒的再侵染，如果症状不显现，则不易淘汰，且经多代无性繁殖后，生活力也有所下降。一般说来，脱毒蒜种植5～6代之后需要用脱毒原原种进行更新换代，复壮种性。
（5）良种良法，充分发挥品种特性
通过良好的田间栽培管理措施，确保品种优良特性得以发挥。利用和创造适合种性的生育条件。采用有利于加强品种特性的栽培措施。
（6）用气生鳞茎繁殖复壮
选用足够大小的气生鳞茎做种蒜是形成正常抽薹、分瓣蒜的物质基础。用气生鳞茎繁殖使蒜种复壮的方法有其特殊优势，一是繁殖系数较高，是蒜头种蒜繁殖的3～6倍；二是后代生长势强，产量高。基本步骤包括：
①选种圃：选择具有原品种特性的健壮优株的蒜头供原种田用。
②原种田：用所选择的蒜头来生产大粒、饱满的优质气生鳞茎种子。
③原种1代繁育田：将气生鳞茎培育成蒜头，尽量减少独头蒜，增加分瓣数，提高繁殖系数。
④原种2代繁育田：创造良好的生长发育环境条件，发挥气生鳞茎后代优势，提高优良种性。