北京，是全国教育最发达的地区之一。截至2016年，北京市共有普通高等院校91所，其中包括北京大学、清华大学、中国人民大学、北京师范大学等全国最为著名的学府。全年本专科在校生达到57.7万人。
北京市共有52所高等学校和117个科研机构培养研究生，在学研究生达到20.9万人。
北京拥有世界第三、亚洲第一大图书馆：中国国家图书馆，前身为北京图书馆，始建于1909年京师图书馆。北京大学图书馆、中国科学院国家科学图书馆也是亚洲较大的图书馆之一。
北京是全国高等院校的中心，聚集了全国数量最多的重点大学。
北京大学，初名京师大学堂，是中国近代第一所国立大学，也是最早以“大学”之名创办的学校，其成立标志着中国近代高等教育的开端。北大是中国近代以来唯一以国家最高学府身份创立的学校，最初也是国家最高教育行政机关，行使教育部职能，统管全国教育。北大催生了中国最早的现代学制，开创了中国最早的文科、理科、社科、农科、医科等大学学科，是近代以来中国高等教育的奠基者。
北京大学，由教育部直属，中央直管副部级建制，是国家双一流、211工程、985工程、2011计划重点建设的全国重点大学；是九校联盟（C9）及中国大学校长联谊会、亚洲大学联盟、东亚研究型大学协会、国际研究型大学联盟、环太平洋大学联盟、东亚四大学论坛、国际公立大学论坛、中俄综合性大学联盟重要成员。
清华大学，由教育部直属，中央直管副部级建制，位列“211工程”、“985工程”、“世界一流大学和一流学科”，入选“基础学科拔尖学生培养试验计划”、“高等学校创新能力提升计划”、“高等学校学科创新引智计划”，为九校联盟、中国大学校长联谊会、东亚研究型大学协会、亚洲大学联盟、环太平洋大学联盟、清华—剑桥—MIT低碳大学联盟成员，被誉为“红色工程师的摇篮”。
清华大学的前身清华学堂始建于1911年，因水木清华而得名，是清政府设立的留美预备学校，其建校的资金源于1908年美国退还的部分庚子赔款。