北宋宋神宗时期，宰相王安石推行变法革新，吕慧卿的政治理念与王安石相同，而深受王安石的器重，二人形同师徒。
有了王安石的引荐，吕慧卿的仕途平步青云，他积极配合王安石的变革，在革新变法中发挥了重要的作用，成为王安石变法的二号人物，王安石十分看好这个弟子吕慧卿，事无大小，王安石都与他商量，探讨，结下了深厚的友谊。
王安石的改革遭到了以司马光为首的保守派的强烈反对，吕慧卿也深受其害，他与司马光经常在朝廷上激烈争辩。
有了宋神宗的支持，王安石的改革继续前行，司马光有了皇太后的鼎力袒护，保守派在朝中竭力排挤王安石，王安石不得不请辞回家。吕慧卿升任参政知事，一边继续王安石的改革，一边不遗余力的与司马光的保守派明争暗斗，始终稍占上风。
当然，吕慧卿后来的改革涉及到王安石的家人，因此与王安石之间渐渐的产生了一些矛盾，为了各自的利益，最后也反目成仇。宋哲宗登基后，皇太后掌权，保守派势力席卷而来把持朝政，吕慧卿也遭到了排挤、打压，被贬出京，从此远离政治中心。
以后虽然也得到了宋哲宗、宋徽宗的任用，但一直是官微言轻，发挥不了作用，直至终了。吕慧卿的大半生都被卷入改革派与保守派的斗争之中，他的人生几起几落。他与王安石的关系是前友后敌，后人对他的评价也是与王安石紧密相连的，反对王安石的人认为吕慧卿背信弃义，人格低劣。
赞成王安石改革的人认为吕慧卿是卓有才能的政治改革家。总而言之吧，吕慧卿尽忠职守，做好了自己的本职工作，没有辜负皇帝对他的信任，算称职吧
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