《夺宝奇兵5》有彩蛋分别是标志性的威廉尖叫、玛丽昂的离婚文件和照片、海伦娜和圣杯、揭示了印第安纳·琼斯儿子的命运、与星球大战挂钩、它属于博物馆等等。
1、标志性的威廉尖叫
威廉尖叫是一个影视剧常用声音效果。该声效常用于角色被枪击，或者从高处坠落时。威廉的尖叫是无数电影中都能听到的经典音效，在《星球大战》和《夺宝奇兵》等多部电影中，都可以听到。在《夺宝奇兵5》电影中，当印第安纳·琼斯把一个反派扔下火车的时候，威廉尖声在劫掠火车上响起。
2、玛丽昂的离婚文件和照片
玛丽昂曾是印第安纳·琼斯的妻子。在《夺宝奇兵5》的时间轴中，印第安纳·琼斯已经70岁了。他是一个考古教授。在第四部电影中，他终于娶了玛丽昂，但是在第五部电影的故事中，他仍然独自生活。在印第安纳·琼斯盖住冰箱上玛丽昂的照片之前，观众们可以看到厨房柜台上的离婚文件。
3、海伦娜和圣杯
当菲比·沃勒-布里奇扮演的海伦娜，第一次找到印第安纳·琼斯的时候，她声称自己是考古学专业毕业的，正在寻找安提基西拉Antikythera），这正是她父亲痴迷的装置。这回顾了印第安纳·琼斯的过去和父亲老亨利·琼斯，他们在《夺宝奇兵3》中痴迷于圣杯。
4、揭示了印第安纳·琼斯儿子的命运
在纽约的追捕之后，电影中提到了印第安纳·琼斯的儿子，又名亨利·琼斯三世。他已经死亡。也因为儿子的死亡，导致了玛丽昂和他离婚。电影用这种方式，解释了《夺宝奇兵4》的男演员希亚·拉博夫，为何缺席了第五部电影。当然，对于印第安纳·琼斯来说，这是一个悲剧。
5、与星球大战挂钩
印第安纳·琼斯透露儿子的遭遇，以及海伦娜询问关于玛丽昂的问题场景中，印第安纳·琼斯说玛丽昂不想和他说话。这致敬了《星球大战：原力觉醒》中，哈里森·福特扮演的汉·索罗对莱雅的评论。这是一个非常相似的弧线和对话。值得一提的是，《夺宝奇兵》和《星球大战》一样，都有乔治·卢卡斯的影子。所以，这两个系列经常会相互致敬。
6、它属于博物馆
在《夺宝奇兵5》的大部分情节中，印第安纳·琼斯和海伦娜相处的都挺不愉快。因为他无法容忍海伦娜的生活方式。海伦娜最初想把命运之盘卖给出价最高的人。很自然地，这触发了印第安纳·琼斯的经典台词：“它属于博物馆”。
