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当前搜索:
知道基因序列怎么设计引物
如何
利用Primer6.0进行
引物
的
设计
?
答:
1.首先,选取目的
基因序列
,对格式没有什么要求,只需要将目的基因序列复制就可以。2.打开File目录下的New,选择Sequence。这里的另一个Project选项是导入文件的方式,也就是将目的基因以文件形式保存的可以直接导入文件。一般通过复制的方式会更方便。3.打开Sequence后,会弹出粘贴框,只需要将刚刚复制的基...
[实用技巧] 构建
基因
过表达载体之
设计引物
详细步骤
答:
对于下游
引物
,我们进一步考虑了保护碱基,确保酶切位点的稳定连接(5.4 图)。最终,我们的引物组合如下:上游引物为CTCGAG CG ATGGAGGAGCCGCAGTCAG,下游引物为ATA GC GGCC GC TCAGTCTGAGTCAGGCCCTTC。至此,我们已经成功
设计
出p53到PCI-neo载体的引物,万事俱备,只待进行PCR酶切连接实验,以实现
基因
...
测序
引物怎么设计
答:
首先,
我们可以在数据库中找到该区域的序列信息,然后根据上述原则设计一对长度为20个碱基、GC含量约为50%的引物
。接着,我们可以利用引物设计软件检查这对引物是否存在内部二级结构或引物间的互补情况。最后,将设计好的引物送到实验室进行PCR扩增和测序验证。如果发现PCR效率不高或者测序结果不理想,我们可...
怎样
在NCBI的primerblast里
设计
Q-PCR的
引物
?
答:
1、首先打开NCBI,选择“Nucleotide”,并在搜索框输入基因名
。一般用目标基因的突变体1去设计引物,也就是要选择目标基因的“transcriptvariant1,mRNA”,没有1就用2、3,以此类推。因为是Q-PCR,所以要去掉内含子,因此用mRNA。2、从上一个页面点击FASTA,可以看到mRNA的序列。3、搜索“NCBIBLAST”并...
已知动物PRL
基因序列如何设计引物
答:
1,分析序列中有哪些酶切位点,避开这些位点,结合你所选用的载体,选择一对上下游酶切位点
2,上游引物设计:选取正向5’-3’的基因序列约23bp左右,copy下来;在这段序列的5’端加上你的上游酶切位点(一般6bp),再在之前加入两个任意碱基作为保护碱基;序列为:保护碱基(2bp)+上游酶切位...
知道基因序列
后,
怎样
找到编码蛋白的序列,接着
怎么
进行
引物设计
?求详 ...
答:
1 NCBI--Sequence Analysis--ORF finder--将
序列
贴进去——OrfFinder 2 NCBI -- Primer-BLAST-- 将序列贴进去-- 设定参数 -- get primers 就可以拿到一些
引物
,然后比较筛选;当然还可以到一些软件里去
设计
,如Primer 3等。
内参
基因
有8个转录本应该
怎么设计引物
答:
为了
设计引物
,首先需要获取内参
基因
的
序列
信息,然后根据序列信息设计引物,一般情况下,每个转录本都需要设计一对引物,一个引物用于定位转录本的5'端,另一个引物用于定位转录本的3'端。
如果要使用PCR扩增一段已知的
DNA序列
,要
如何设计引物
答:
把这段
基因
输入
设计
软件里,调节
引物
位置,使变性温度在94度,退火温度=Tm-(5到10度) 延伸温度72度左右,满足这些条件基本就可以了,当然还要根据实际情况多次实验得到最佳引物。如果你要扩增整个的基因,引物必须要在起始密码子之前,或包含起始密码子。最后加上酶切位点就可以了。
如何
进行
引物设计
?
答:
8、特异性:
引物
最好在模板cDNA的保守区内
设计
。引物应与
核酸序列
数据库的其他序列无明显同源性,不应有连续8个碱基与待扩增区外序列完全互补。可对其进行BLAST检测进行验证。引物的验证很多时候,我们可能从文章中、实验室遗留的资料中,翻找出了某对引物,但是这个时候往往我们心里是可能没底的。这个时候...
...号,可是上genbank blast一下,只有它自己,
怎么设计引物
?
答:
有
基因序列
号,你就可以直接上genebank下载其序列,下载到全序列,你需要扩增的CDS区,也就是编码区,可以全外显子扩增,这样简单一点,也可以做cDNA克隆,然后再做,前者的话就可以直接根据其基因序列NG号
设计引物
,如果是做CDNA的话就根据其mRNA的序列NM号设计引物。
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