哈齐高铁设置车站数量：11个（其中改造6个，新建5个），分别是哈尔滨西站、哈尔滨站、哈尔滨北站、肇东站、安达站、大庆东站、大庆西站、泰康站、红旗营东站、齐齐哈尔南站、齐齐哈尔站。 与其对接线路为：哈大高铁，哈牡客运专线，哈佳快速铁路。其中哈尔滨北站、大庆东站、大庆西站、红旗营东站、齐齐哈尔南站5个为新建站。
哈尔滨北站
新建哈齐高铁哈尔滨北站总建筑面积9967平方米。候车大厅为两层设计，最多可供3400人同时候车。全站设4座站台、10条铁路到发线，站房高峰每小时可发送旅客3800人。
哈北站远期规划将建设南北两个广场，其中南广场规划建设长途客运枢纽，解决北部来哈长途客运换乘问题。根据哈市地铁建设规划，即将建设的地铁2号线在哈北站设站点，从该站下车的乘客可直接乘地铁，直达哈尔滨火车站，实现国铁、地铁间的“零换乘”。
大庆东站
大庆东站由原大庆龙凤火车站改建而成，位于大庆市龙凤区，总占地面积约27万平方米，建设规模为1.5万平方米，共设4个站台（其中1、2、3站台为高站台，4站台为低站台）8条铁路线，总投资约4.5亿元。大庆东站于今年3月11日零时起投入使用，并开通客运业务。
为与大庆湿地以及原龙凤站站名相契合，大庆东站设计时特别强化了“飞”的寓意，建筑主体造型就像一只展翅高飞的凤凰。
大庆西站
大庆西站位于大庆市让胡路区，哈齐高铁、滨洲铁路、通让（内蒙古通辽—大庆让胡路）铁路以及规划中的大庆至绥化铁路在此交汇。大庆西站是哈齐高铁沿线车站中唯一一个采用高架候车室，无站台柱风雨棚，且全部站台均为高站台的车站。
齐齐哈尔南站
齐齐哈尔南站是我国最北端的高铁车站。该站高站台、自动售票机等各种现代化设备一应俱全，车站东侧还建有齐齐哈尔公路客运枢纽南站，方便乘客公铁换乘。
齐齐哈尔南站以飞翔的丹顶鹤为主要设计元素，彰显了城市的特色。地下室部分顺接新建出站地道，旅客出站可乘电梯至齐齐哈尔市新建车站广场。
沿线车站设置表车站名称站台数、到发线数站房面积车站等级备注哈尔滨西站 18台22线 70000平方米 特等站 枢纽站，始发站，终到站
高架候车室，无站台柱雨棚 哈尔滨站9台16线42122平方米特等站枢纽站，始发站，终到站哈尔滨北站10台16线9967平方米一等站新建车站肇东站3台9线 二等站安达站3台5线 二等站大庆东站4台8线15000平方米一等站新建车站大庆西站8台13线50000平方米 一等站枢纽站，始发站，终到站
高架候车室，无站台柱雨棚 泰康站4台8线 二等站红旗营东站1台2线 整备站，预留站齐齐哈尔南站12台14线29957平方米一等站 始发站，终到站，新建车站齐齐哈尔站 7台10线 18000平方米 特等站 枢纽站，始发站，终到站
