香港政府为了提升铁路运输系统的效率，实施了一项重大决策，即计划将地铁与九广铁路进行合并。2004年2月24日，政府邀请两家公司对这一合并计划进行了深入讨论，预期在六个月内完成磋商，目标是在2005/06财政年度实现两铁的整合。这一举措引起了社会各方面的广泛关注和讨论。
支持者认为，合并后有望削减行政成本，为未来的票价调整提供了可能，使得票价有可能下调，从而为乘客带来实惠。然而，也有人担忧，合并可能导致运输系统的独立性减弱，甚至可能形成垄断，这在一定程度上引发了对服务质量的忧虑。
2006年4月11日，香港行政长官曾荫权宣布，行政会议已经批准了两铁合并方案。决定将九广铁路公司的经营权转交给地铁公司，同时实施了一系列优惠政策，包括取消转车闸费，引入“可加可减机制”，并优先处理沙中线转车问题以及优化部分转车站的转车设施。在实施这些改变之前，政府还在征求市民的意见，对相关条例进行修改，并等待新条例在立法会获得通过以及地铁有限公司股东的同意，以确保合并计划的顺利进行。
最终，2007年12月2日，地铁与九铁以租赁经营的方式正式合并，地铁公司获得了九铁公司50年的使用权，标志着这一融合过程正式落地实施。
香港的地铁（MTR），原称地下铁路（Mass Transit Railway），是香港的通勤铁路线，由香港铁路有限公司（前地铁有限公司，MTR Corporation Limited）营运。地铁自1979年起为乘客提供市区列车服务。2007年12月2日，地铁与九铁的车务运作正式合并；当天，九铁营运告终；与此同时，地铁公司也易名为港铁公司。合并后的综合铁路系统全长168.1公里，由9条市区线共80个车站组成。