零陵区林业局下属的事业单位包括多个部门，它们各司其职，共同维护和保护森林资源。其中，森林公安分局作为副科级机构，负责打击破坏森林资源的犯罪活动，监督案件查处，并进行林区治安管理与火灾预防。林业检察科则以正股级别，致力于打击毁林犯罪，保障森林资源安全。林业审判庭以正股级别处理林业案件，调处纠纷并监督政府依法行政。
野保处以副科级管理陆生野生动植物资源，负责濒危物种的进出口审批，以及查处破坏野生资源的行为。植物检疫站负责全区的森林病虫害防治和检疫工作。森林调查队负责森林资源调查、监测和统计。林业科技推广站则通过科普、试验新技术和提供技术服务，推动林业发展。
绿化办专注于国土绿化规划和实施造林活动，林业工作管理站则负责森林资源保护、技术推广和法律宣传。林业基金管理站管理林业基金，监督收支。木材检查站确保木竹采伐与运输的合法性，保护森林。区苗圃和三个林场如水口山、大庙头和石岩头，则以竹木种植、采伐和护林防火为主要任务，在职人员众多。
此外，零陵区林业局还拥有三个国有企业，包括区木材公司、国营食品饮料厂和汽车运输队，这些企业在林业领域也有着各自的职责和人员配置，目前正在进行国有企业改革。