北京积水潭医院建立于1956年，自建院开始便开始了骨与软组织肿瘤的诊治，1977年，积水潭骨肿瘤独立成组，1984年，积水潭骨肿瘤独立成科。北京积水潭医院骨肿瘤科自成立以来，收治骨肿瘤患者近10000例，目前正以每年约800例的速度增长，每年的骨与软组织肿瘤手术病例数居亚洲第一，在世界范围内也首屈一指。我科现有住院患者百余人，诊断治疗水平国内领先，与国际同步。我科建有独立的病例资料室，保存了自建科以来所有患者的影像资料和随访资料，正逐步建成国内收存资料最为丰富的数字化肌肉骨骼系统肿瘤数据库，为每一位新患者治疗方案的设计和骨与软组织肿瘤的研究提供了坚实的基础。
北京积水潭医院建立于1956年，是一所以骨科和烧伤科为重点的三级甲等综合性医院。自建院起，便开始了骨与软组织肿瘤的诊治，我国规范化的骨与软组织肿瘤的诊治最早可追溯至此，当时我院骨科进一步细分为矫形骨科组、显微外科组、手外科组，骨肿瘤患者由矫形骨科医师负责治疗。最常见的原发骨恶性肿瘤是骨肉瘤，当时的治疗方法主要为手术。从1959年10月开始，受国家卫生部委托，我院开始举办全国骨科医师进修班，为全国各省市医院培养了许多骨科医师骨干。
孟继懋教授是我院第一任院长，孟院长对医术精益求精，对待每一位病人的诊断与治疗一丝不苟，分析精辟，判断准确，方案完善。即便是常见病多发病，他也是细致入微地了解病情，认真做全面及局部检查，然后才研究诊断及治疗方案，从不轻易作出决定，更不单凭X线片提出诊断治疗意见。当时，国际上骨与软组织肿瘤患者的治疗没有突破性的进展，尤其是骨肉瘤的5年生存率大约只有20%，但孟老院长带领北京积水潭医院的骨科专家们对骨肿瘤的诊断与治疗进行有益的探索，因此我院的骨与软组织肿瘤水平一直与国际同步。由于突出的工作业绩，孟老院长受到开国领袖毛主席的亲切接见。
经过21年的努力，由于到北京积水潭医院就诊的骨与软组织肿瘤患者数量急剧增加，我院在1977年8月在矫形骨科内成立骨肿瘤专业组。1984年独立为科，病床27张，宋献文教授为第一任科主任，先后主持了完成骶骨肿瘤截除术（1978年）、异体半关节移植术23年随访骨巨细胞瘤的治疗及50例分析（1978年）、骶骨肿瘤的手术治疗（1984年）、人工智能在骨肿瘤专家系统中的应用（1986年）、酒精灭活再植的试验研究（1986年）等多项成果。其中骶骨肿瘤的切除是我科在国内首先开展，打破了当时认为的骶骨肿瘤是外科手术禁忌症的说法，骶骨肿瘤截除术于1978年获“全国医药卫生科学大会奖”，为日后骨肿瘤科的骶骨肿瘤诊治水平领先全国打下了坚实的基础。早在20世纪50年代，我院即首先应用了同种异体骨治疗骨肿瘤，二十世纪八十年代，异体骨半关节及酒精灭活再植术的研究成果为我国治疗恶性骨肿瘤，广泛采用酒精灭活再植术保留肢体，提供了坚实的理论基础。在之后近20年的时间内，灭活再植治疗肢体骨肿瘤因设备条件要求简单、费用低廉而被国内各省市广泛采用，成为最主要的既经济又有效的保肢治疗方法，为广大恶性骨肿瘤的青少年患者保留肢体，避免截肢。
宋献文教授任中华医学会骨科分会骨肿瘤学组首任组长，为开创全国骨肿瘤事业作出了巨大贡献，是国内公认的骨肿瘤专业先驱，在骨肿瘤诊治实践中最早倡导了临床、影像和病理三结合，这种科学的方法一直沿用至今，成为当今国内骨肿瘤专业尊崇的诊治原则之一。于1982年、1985年举办了第一、三届全国骨肿瘤学习班，1983年出版骨肿瘤学汇编。
1986年徐万鹏教授为第二任科主任，骨肿瘤科病床数由20余张逐渐增至50余张，丰富的临床诊治经验确立了骨肿瘤科在全国骨肿瘤学组的领先地位，先后于1990年、1992年举办了第五届全国骨肿瘤学习班和第一届中国恶性骨肿瘤保肢会议，完成了股骨恶性肿瘤大腿节段性截除小腿旋转上移术（1983年）、应用切刮术骨水泥填充治疗局灶性骨肿瘤（1989年）、上颈椎病变的外科治疗（1990年）、上颈椎骨肿瘤的外科治疗（1991年）、腹主动脉阻断（1992年）、髋臼周围肿瘤的外科治疗（1995年）等成果，与其他科室合作完成“ 成骨肉瘤的超声诊断及彩色多普勒血流显像特征”（1994年）、超声诊断和彩色多普勒血流显像技术在骨转移癌诊断中的应用研究（1995年）、 骨巨细胞瘤的超声影像诊断及彩色多普勒血流（1998年）等成果。在全科医师的共同努力下，徐主任主编出版了《骨转移瘤的诊断与治疗》和《骨与软组织肿瘤化疗》（1992年）两部著作，出版《骨肿瘤评价与治疗译文集》（1992年）一部；1990年开始筹建骨肿瘤资料库的建设；1992年我院深低温冷冻同种异体骨骨库成立，使异体骨移植治疗骨肿瘤更进一步科学化、规范化，而异体骨的使用也发展为半/全关节，1/4关节，异关节复合，异体骨等多种方式；其中上段椎体肿瘤的外科治疗也是创新性的工作；1992年我科对骨肉瘤病人的化疗进一步规范化、统一化，为日后大宗骨肉瘤病人的长期随访研究提供了坚实的基础。徐万鹏教授任中华医学会骨科分会骨肿瘤学组组长。在做出以上大量研究并获得许多成果的前提下，我们还为当时没有骨肿瘤专业的北京大学人民医院提供了大量的手术标本，为基础研究的顺利进行提供了原材料。
