引起男性尿道口痛的原因有很多:
1泌尿感染疾病可能导致尿痛。男性泌尿生殖系感染均可不同程度地影响泌尿道、性腺、附属性腺以及外生殖器的正常生理功能，最为显着的是影响性欲和性功能，可导致性欲或性功能低下。这是男性尿痛原因之一。
2生殖器官疾病可能导致尿痛。男性生殖器官疾病，常常引起男性不育，以及其他泌尿疾病。其中常见的男性包皮过长、包茎等。包皮过长的男士性比正常健康的男性患早泄的概率要大的多，甚至是几倍，他们之间产生着必然联系。
3前列腺疾病可能导致尿痛。前列腺炎是最常见的男性疾病，一旦出现前列腺方面的疾病，它就会传染很多的器官。患者除了感到会阴部、外阴部、大腿根部等处隐痛不适，小腹胀痛和男人尿急尿痛、尿频、尿不畅、尿不尽、尿等待等排尿障碍，还常伴有肛口不适、刺痛、下坠和排便不尽或出血症状。