在政治层面，明清时期君主专制的强化导致皇权无上，民主制度难以孕育。皇帝集立法、行政和司法权于一身，不受任何监督，决策带有个人独断和随意性，政策失误频发。官僚体制中，官员们畏首畏尾，助长了官场的保守、腐败现象。这种绝对的君主专制实际上是封建制度衰落的象征，如明朝的厂卫制度和清朝的军机处，进一步抑制了民主的可能。
在经济方面，君主专制的强化束缚了生产力发展，阻碍了资本主义的萌芽。农民贫困无法购买手工业品，地主和商人资金主要用于土地投资，而非扩大再生产。清朝的关卡重税和闭关锁国政策，限制了商品流通和手工业扩张，导致海外贸易受阻，阻碍了经济的进步。
在思想文化上，君主专制加强导致思想禁锢，扼杀了创新。明朝的八股取士和清朝的文字狱，压制了民主思想，知识分子只能在僵化的文体中受限，聪明才智被压抑，形成文化上的“万马齐喑”。反封建思想被严格禁止，科技发展受到严重阻碍。
对外关系上，明清时期的闭关锁国政策使中国与世界隔绝，落后于国际潮流。明朝的“海禁”和清朝的长期封闭政策，阻碍了与世界的交流，妨碍了学习和引进先进的思想文化和科技，使中国逐渐落后于世界。
正是在君主专制达到顶峰之时，西方已开始在权力制衡下构建近代民主制度，步入近代社会，为资本主义的发展铺平道路。而中国高度集权的君主制度，阻碍了社会创新，延缓了社会发展进程，使得中国在近代历史中处于被动落后的地位。
君主专制制度：指以古代君王为核心的中央集权的政治体制，它脱胎于原始社会后期的父权制。宗教祭祀与军事征伐是君主专制的头等大事，即所谓“国之大事，在祀与戎”。古代中国的“王”字，有两种解释。一是董仲舒的看法，参通天地为王；二是甲骨文中的“王”，为斧的象征，故而历史传说中的周公“负斧依南向而立”。