1、公司要上缴40%，是上缴到当地总工会，到地税去办里手续。
2、上级返还部分，如果是工会单独建账核算，先返还到公司账上再划到工会账户上。如果是工会没有单独建账核算就直接返还到公司账户上就行了。
3、企业工会组织应到当地基层总工会领取《工会经费收入专用收据》，拨付工会经费给工会组织时，公司应凭工会组织开具的《工会经费收入专用收据》直接从公司账上划到工会账上。工会组织开具了《工会经费收入专用收据》的，企业所得税汇算时可以全额抵扣。
扩展资料：
根据《工会法》的规定，工会经费的来源有五个方面：一工会会员缴纳的会费；二建立工会组织的企业、事业单位、机关按每月全部职工工资总额的百分之二向工会拨缴的经费；三工会所属的企业、事业单位上缴的收入；四人民政府的补助；五其他收入。
工会会员缴纳的会费
工会会员缴纳会费是会员应尽的义务，同时也是会员在工会组织内部享受权利的物质基础。会员缴纳工会会费，体现了会员的组织观念，密切了会员与工会组织的联系，同时也有利于职工之间的互助互济和团结友爱的精神的增强。
会费交纳的标准，是根据不同时期会员的收入情况和工会工作情况，由全国总工会统一制定的。现行标准，根据全国总工会1978年工发101号通知规定，工会会员每月应向工会组织缴纳本人每月基本收入0.5%的会费。工资尾数不足十元的不计交会费。
只要企业发给的是“工资”，而不是发的奖金、津贴或补贴，就应按本人所得的工资收入计算交纳会费。会员缴纳的会费，全部留在基层，用于工会开展活动，勿需上交。
参考资料来源：