东莞市华美汽车销售服务有限公司的机构设置遵循国家税务规定，旨在高效管理税收工作。公司设有多个部门，各自承担特定职责：
办公室负责全局年度计划、政务处理、文件起草、会议组织、秘书事务、文电管理、保密工作，以及税收科研、科研成果管理和目标管理考核等。
计划统计科负责税收计划、会计统计、信息分析，包括税款管理、税源调查和税收分析等工作。
征收管理科负责税收征管法规的执行，涉及征管质量监控、电子申报推广、税务登记管理、纳税评估和日常检查指导等工作。
政策法规科负责税收法规监督、税务行政复议、涉税法律事务，以及规范税收执法和税务行政许可等工作。
税政管理科负责流转税和所得税等税种的政策管理，包括增值税稽核、税收协定执行和发票管理等。
人事教育科负责干部管理、教育培训、思想政治工作以及离退休人员的管理等。
监察室负责行政监察、廉政建设，以及对税收法律、法规执行情况的监督工作。
直属稽查局负责税务专业稽查，对重点税源和违法案件进行查处。
城区税务分局和农村税务分局负责各自区域内的税收管理工作，分别负责城区和乡镇的纳税人税收管理。
事业单位信息中心则负责信息系统建设和数据处理，以及计算机网络管理和维护。