集团为2004年7月8日机场属地化改革移交甘肃省政府整体变更而组建成立。 2006年5月25日，甘肃省政府国资委与美兰国际机场签订了产权重组协议，10月27日，新的甘肃机场集团正式挂牌成立。
2011年，受甘肃省政府委托，经营管理新建成的金昌、张掖两个机场。其中集团本部统一管理集团范围内的规划、财务、人事等工作；下属机场则在集团的统一指导下，负责机场航空业务保障、安全管理及部分发生在机场范围内的航空延伸辅业的服务和经营管理工作。
重组五年来，在国家一系列发展政策的推动和地方各级政府的指导支持下，通过与海航集团在管理理念、管理模式、管理制度、企业文化的对接以及各类航空旅游资源的共享，甘肃机场集团各项事业取得了长足的发展。截止2010年，甘肃机场集团共实现旅客吞吐量396万人次，年均增幅18.48%，创甘肃机场历史最好水平；航线网络日益完善，目前已与国内外10余家航空公司建立了航空业务往来，高峰时期四机场累计执行航线40余条，其中兰州机场航线可通达全国32个城市和香港地区；安全运行品质稳步提升，各机场先后顺利通过了安全审计和保安审计，兰州中川机场正式上升为国际口岸；航空产业链不断得以重塑和优化，使机场的服务及甘肃省的航空旅游产品更具综合竞争力；积极履行社会责任，先后组织了捐资助学、扶贫助残、“光明行”等多项公益活动，全力保障了陇南地震、舟曲泥石流等抗险救灾运输任务，捐助救灾款物达1000余万元，得到了社会各界的广泛赞誉。
随着国家支持甘肃发展政策的出台及甘肃省委省政府一系列加快区域发展战略的逐步实施，甘肃机场迎来了难得的历史发展机遇。下一步，甘肃机场集团将以海航“举全集团之力、给力甘肃发展，未来3—5年在甘肃投资100亿元”的政策为指引，以现有机场扩建为契机，进一步发挥海航集航空运输、机场管理、航线资源为一体的优势，继续加大机场投资建设力度，积极参与甘肃支线机场的建设运营；同时借助海航强大的航空旅游上下游产业链优势，全面打造区域平台，切实加强与地方各级政府在地产、商业、旅游、物流等领域深层次、多角度的战略合作，为推进甘肃跨越式发展、构建甘肃内陆开放型经济新格局的战略目标做出新的更大贡献。
