全基因合成钱对目的基因序列进行GC含量和重复序列分析的软件是什么？

Question

全基因合成钱对目的基因序列进行GC含量和重复序列分析的软件是什么？
有人提供一下名称或者网址吗？谢谢

Answer 1

1.可以使用在线分析工具RepeatMasker： http://www.repeatmasker.org/，重复序列和CG含量都可以同时分析出来。
2.另外也可以使用DNAstar。下载安装DNAStar软件包；打开NAStar软件包里的EditSeq软件；在打开的界面里依次点击File、Open，打开所要分析的序列；用鼠标选定打开的序列后，依次点击Goodies、DNAStatistics；此时弹出一个文本框，显示GC含量等信息。

Answer 2

　　生物信息学各个领域中的软件数目庞大，在EBI 1997年的分子生物学程序目录中就收录了530多种常用软件。
　　序列比对和数据库搜索软件有BLAST，FASTA，BLITZ等；
　　综合序列分析软件有VCctor NTI Suite，DNA Tools，Omiga，DNASIS等；
　　与蛋白质分析有关的程序有AnthePro，AminoXpress，DSSP等，大型分子生物学软件包如GCG。并行算法、遗传算法、面向对象算法等已被应用到最新的程序中。
　　生物研究者期望通过他们的知识，从文献中得到的信息以及他们的经验来对基因预测的分析数据进行解释，由此来进行设计和实施实验，并对他们的解释进行确证、改进或反驳。因此，可以促进实验设计的序列分析软件有明显的优点。在如此众多的生物软件面前，什么是生物学研究者所期望的、有帮助的、高效率的序列分析软件？一般要求这些软件可以提供基因的预测、重复序列的鉴定、限制酶分析、引物设计、在线序列比对、质粒作图、结构域（motif）查找、RNA二级结构预测、克隆策略图谱、三维结构显示等方面的内容；并且要求软件的算法简洁、效率高和可移植性好[3]。目前Web站点可以对基因序列提供计算前的分析，并且这些站点允许使用者下载到客户机上分析自己的序列。随着酵母基因组序列、鼠基因组序列和人类基因组序列的完成，会产生诸如模式识别和神经网络等先进的计算方法，并应用于新的软件中，并对生物医学研究的深入发展发挥巨大的作用。