上饶市环境保护局的主要职责如下：
1. 政策执行与规划制定：执行国家和省里的环保方针、政策和法规，制定并监督实施环保规章。在全市总体规划中，负责环境保护规划的拟定和执行，包括环境功能区划、重点区域防治和水源地保护规划，以及参与主体功能区划的制定。
2. 环境问题管理和协调：负责重大环境问题的协调，领导处理重大环境污染和生态破坏事件，指导突发环境事件的应急工作，处理跨区域纠纷，并协调流域和区域的污染防治。
3. 污染减排与投资监督：承担减排目标的落实，制定污染物排放总量控制和排污许可证制度，审批和发放水污染物排放许可证，监督减排任务完成情况，实施环保目标责任制和总量减排考核。
4. 环保投资和产业发展：配合投资项目的实施和监督，推动循环经济和环保产业的发展，参与应对气候变化工作。
5. 源头预防和控制：对重大经济政策和规划进行环境影响评估，提出环保方面的意见，审批环境影响评价文件。
6. 污染防治监管：实施多种污染源的防治管理，包括水、气、土壤、噪声等，监督饮用水源地保护，指导城镇和农村环境整治。
7. 生态保护指导与监督：制定生态保护规划，评估生态环境质量，监督自然资源开发利用和生态恢复，指导各类保护区的环境保护工作，协调野生动植物、湿地和荒漠化防治。
8. 核与辐射安全：配合省厅进行核与辐射安全监管，参与应急处理工作，管理核设施和放射源安全。
9. 环境监测与信息发布：制定监测制度，组织环境质量监测，发布环境信息，建立环境质量公告制度。
10. 科技工作与国际合作：推动环保科技发展，组织国际环保交流，处理涉外环保事务，开展环保宣传教育。
11. 人事与机构编制：负责局机关和下属单位的人事和机构编制管理工作。
12. 其他职责：完成市政府交办的其他相关任务。