清初：军区司令+当地行政长官。
清中以后：雍正废止了八旗旗主对于本旗所有人员的隶属权之后（仅保留了直属包衣的隶属），旗主王爷都快成荣誉称号了。
努尔哈赤生前的八旗旗主，由于历史原因，八旗的排序:镶黄、正黄、正白，正蓝，镶白，正红，镶红，镶蓝，合称八旗，统领满洲、蒙古、汉军。
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有清一代，由于其族群的特殊性，它不像 *** 政权那样，将军队、政事等分开，而是创立了军政民三合一的组织形式，即八旗制度。
明万历二十九年（1601年），努尔哈赤整顿编制女真人口，初设黄、白、红、蓝4色旗，编成四旗。后增设镶黄、镶白、镶红、镶蓝4旗，八旗制确立。丁壮战时为兵，平时为民。每一旗均设有旗主。
努尔哈赤生前的八旗旗主以及分布分布大致是这样的：
努尔哈赤生前的八旗旗主，由于历史原因，八旗的排序：镶黄、正黄、正白，正蓝，镶白，正红，镶红，镶蓝，合称八旗，统领满洲、蒙古、汉军。
正黄旗：努尔哈赤
镶黄旗：努尔哈赤
正红旗：努尔哈赤次子代善
镶红旗：代善长子岳托
镶蓝旗：努尔哈赤同母弟舒尔哈齐次子阿敏
正蓝旗：努尔哈赤第五子莽古尔泰
正白旗：努尔哈赤第八子皇太极
镶白旗：努尔哈赤长子褚英长子杜度
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八旗起源
八旗制度最初源于满洲（女真）人的狩猎组织。结伴而行的狩猎活动因人数增多而需统一指挥，其指挥者称为牛录额真，这个多人集体即称为牛录。女真人在对外防御与征伐过程中采取了以牛录额真统领牛录的组织形式，从而牛录组织具有了军事职能。
为便于统一指挥大规模的围猎或作战，需将若干个牛录组成一个更大的单位，以旗帜为标志作导引而不使方位错乱。旗帜在满语中称为“固山”，因而这个高于牛录的最大的单位即称为固山，汉语称“旗”。