医学院基础医学部是医学院下属教学机构，下设五个教研室和三个实验中心，五个教研室分别为人体解剖与组织胚胎学教研室、生理学教研室、病原生物学和免疫学教研室、药理学教研室、生物化学与分子生物学教研室、病理学与病理生理学教研室。三个实验中心分别为形态学实验中心、机能学实验中心、分子生物学实验中心。
基础医学部现有教职工21人，其中高级职称专业人员7人，其中教授1人，博士生（含在读）2人，硕士（含在读）7人，包括从日本东京女子医科大学引进免疫学博士一名。
基础医学部共承担着临床医学、护理学、药学、医学检验学、医学影像、中医康复等六个专业的本、专科生、专升本学生、成人教育学生的医学基础课程的教学任务。基础医学部取得的成果：获院级精品课程二门（生物化学、药理学），院级建设课程一门（病理生理学）。基础医学部拥有较为完备的人体解剖学标本陈列室、多媒体显微镜室、免疫学教学实验室、病理切片室和省内一流的分子生物学科研平台，实行了多媒体教学、仿真教学、开放实验室等多种现代化教学方式，为各专业学生的临床学习阶段打下坚实的医学基础，成为培养高素质的、具有创新意识的应用型、技能型优秀医学人才的摇篮。
基础医学部承担着各级各类科研项目20余项，包括省级攻关项目及自然科学基金项目，鉴定科研究成果12项，其中10项达国内先进水平，10余项分获湖北省省教育厅，省卫生厅，黄石市市科协、市人民政府科技进步奖。发表国内外各类科研论文100余篇，其中核心期刊60余篇。参加编写全国统编教材10余部，其中主编全国高职高专规划教材3部。 黄石理工学院医学院药学系具有近70年的办学历史。主要开设药学本科及专科教育，有专职专任教师15名，其中博士2人，在读博士2人，硕士4人，副高以上职称7人，副高以上的院办药厂技术人员2名，注册执业药师2名。
药学专业设有天然药物化学、药理、药剂、药物分析和生物药物五个教研室，以及药化药分、药剂、药理、天然药物学、化学合成室、高效液相色谱室、生物制药室（分子生物学实验室）、微生物与免疫学实验室以及无菌室9个教学和科研实验室，仪器设备总值达200万元，拥有先进的用于药物发现、药物化学、药理、药剂、药物分析以及药物生物学研究的配套仪器设备。院办药厂投资2000多万元，已通过GMP认证，其中设有生物测定室、成品中心化验室、药品开发中心实验室等专业实验室，为药学专业课程教学实践及科研基地。
药学专业培养德、智、体全面发展，能适应中国现代化建设需要，具备扎实的化学、药学、生物学、以及适度的医学等科学基础理论、基本知识和实验技能，具备适度的生物制药工程专业知识和比较系统的生物制药技术专业知识、实验技能，在生物制药应用领域具有良好开拓精神、创新意识和研究能力及业务技术应用能力，能从事药物尤其是生物药物的研制与开发、质量检测、生产管理及技术服务的应用型高素质药学专门人才。
药学系在天然药物研究领域取得了成就，已主持科研项目5项，国家发明专利2项，发表科研论文40余篇；开展大学生科技创新项目多项，开放实验项目多项，学生参与教师科研活动等，第一届药学本科生已发表学术论文多篇。 医学院中医康复系是医学院新兴的系科，创办于2010年，前身是黄石理工学院医学院康复专业和临床系的一部分，2010年9月，组建中医康复系，下设中医基础教研室、康复教研室、针灸推拿教研室。2个实验中心：康复实验中心、中医实验中心。
康复专业主要培养具有博爱情怀和奉献精神，专业知识扎实，专业技能熟练的为特殊教育学校、残疾人士、神经系统疾病等的康复训练机构、各级各类城市社区康复技术指导中心提供诊断测查、功能评估鉴定，开展卫生保健、早期干预及为其他各类残疾人士提供康复训练和指导的高素质应用性专门人才。
中医康复系围绕专业的培养目标、培养规格，制订并逐步完善了教学计划，编写了20余门专业课的教学大纲，并在此基础上编写了一系列专业课教学的讲义和教材，为人才培养质量的提高奠定了良好的基础。
康复专业主要开设的专业课程有：社区康复、康复护理学、康复治疗技术、疾病康复学、康复功能评定、针灸推拿学等20余门。
中医康复系有教职工6人，教授1人，讲师3人，助教2人。具有研究生学历教师2名。
自2006年至2010年已有四年多的办学实践，经过不断的努力与探索，康复系已初步形成了理论教学、实践实训紧密结合，学校培养和岗位培养有序联系的培养模式，医教结合成为系科显著的专业特色。
作为一门在康复医学、社会学、心理学和特殊教育学等学科基础上发展起来的、全新的边缘学科、中医康复系将发展为集教学、科研、培训及社会服务为一体的，产、学、研全面发展的新型科系，成为培养新一代中国康复人才的摇篮。 医学院护理教育历史源远流长，历经中专、大专、本科几个发展阶段，2005年开设护理学本科生教育，设有护理专业本科、专升本及大专三个学历层次，在校护理专业学生近400名。学院护理教育历经八十年积淀，拥有较优质的教学资源和丰富的办学经验，毕业生遍布全中国，赢得了社会的信赖和良好口碑。
护理系下设有基础护理教研室、临床护理教研室及护理实验中心。护理专业主干课程的教师共有35人，其中正高级职称有4人，副高级职称20人，中级职称有8人，初级职称3人，具有研究生学历的有14人。护理系现已具备较完善的教学条件，护理实验中心设有基础护理实验室、ICU室、健康评估实验室、外科护理实验室、妇产科护理实验室、儿科护理实验室、康复护理实验室等，实验设备齐全，能满足各学历层次的实验教学的需求。
护理系以育人为中心，注重现代护理观与中国传统仁爱思想的融合，倡导“仁心人护”的教育理念，培养品格与才能并重的具有创新意识的护理专业人才，力争在护理教育实践中，增强改革意识，打造特色，不断提高教学质量和科研水平。 临床医学系是医学院的常设教学机构。设五个教研室：内科教研室、外科学研室、妇产科教研室、儿科教研室、诊断学和健康评估教研室。临床医学系主要承担临床医学、康复治疗技术专业内科学、外科学、诊断学、妇产科学、儿科学、耳鼻喉科学、眼科学、急救医学、传染病学、社区医学和护理专业健康评估、内科护理学、外科护理学、妇产科护理学、儿科护理学、急救护理学、急救护理学、药学、检验、医学影像技术等专业《临床医学概要》的教学工作。
临床医学系是医学院历史最悠久、师资力量最为雄厚的的系部之一，有专任教师9名：教授2名，副教授4名，讲师3名，其中博士2名（1名在读），硕士4名。此外，临床医学系还聘请大量的黄石地区医院的名医、学科带头人从事教学工作。临床医学系临床医学专业的办学历史已80余年，为黄石乃至鄂东南地区基层医疗卫生保健机构输送了大量的合格的临床医学人才。
临床医学系拟建设：临床技能培训中心1个，附属医院2所，教学医院10余个，社区、乡镇基层医疗卫生保健机构十余所，为临床医学专业学生的实践能力的训练打下坚实的基础。
临床医学系教师除了完成教学任务外，还进行了大量的科研、教研工作：年均完成、发表学术论文10余篇；科研和教研项目课题研究10余项；出版发行著作10余部。
