中山大学医院的医院架构包含多个部门和专科，院本部业务科室组织如下：
科级
内科: 包括血液内科、消化内科、呼吸内科、肾内科、风湿内科、内分泌内科、普内科、内镜中心和内科门诊。
外科: 普通外科、胃肠胰外科、血管甲状腺外科、神经外科、肝胆外科、烧伤外科、泌尿外科、小儿外科、整形修复外科、胸外科和微创外科，以及外科门诊和外科实验中心。
妇产科: 妇科、产科、生殖医学中心和胎儿医学中心，以及计划生育专科。
儿科: 儿科一、二、三专科，以及新生儿专科。
神经科: 神经一科、神经二科和神经科ICU。
心血管医学部: 心内科、心血管CCU和心脏儿科，心脏外科。
骨科—显微外科医学部: 骨科、脊柱外科、关节外科、骨肿瘤科、显微创伤骨科和器官移植科。
其他: 耳鼻咽喉科、中医科、皮肤科、口腔科、眼科、康复科、针灸科等。
北校区门诊部
包括麻醉科、手术室、影像医学部、超声波科、放射科、放射介入专科、放射诊断专科、核医学科、医学检验部、药学部、病理科、供应室等。
黄埔院区业务科室组织
科级: 感染科、心血管内科、神经三科、普通内科、外一科、外二科、外三科、上肢骨科、下肢骨科、脊柱外科、妇科、产科、儿科、康复科、急诊科和麻醉手术科。
专科: 五官科、中皮科、放射科、检验科、药剂科、高压氧科、血库、B超室和预防保健科。
东校区门诊部: 病理科、骨科研究所和病案统计室。
扩展资料中山大学医 院，又称“校医院”或“疗养院”，位于广州市新港西路135号中山大学中区，北部与中山大学中文堂和文科大楼一路之隔，西部靠近怀士堂（小礼堂），东部靠近英东体育馆。