北大医学部好。为北京卓越医学人才培养高校联盟成员单位。下面是这三所学校的各方面对比介绍：
一、师资力量：
1、北大医学部：有大批国际、国内知名的医学教育、研究、临床方面的专家，其中具有高级职称2394人，两院院士12人，“973”计划和重大科学研究计划项目首席科学家19人。
2、协和医学院：学校有两院院士24人，其中中国科学院院士10人，中国工程院院士15人（1人为两院院士）；国务院学位委员会委员1人、学科评议组成员9人。
3、清华医学院：有专职教师83人，其中教研系列56人，教学系列8人，研究系列19人。教师队伍中，诺贝尔奖获得者1人，中国科学院院士2人，中国工程院院士1人。
二、教学建设：
1、北大医学部：北医拥有1个国家重点实验室，1个国家工程实验室，3个国家临床医学研究中心，2个国家国际联合研究中心，43个省部级重点实验室和研究中心。
2、协和医学院：据2020年8月学校官网显示，学校有2个国家特色专业建设点。
3、清华医学院：医学院下设2个系1个中心-基础医学系、生物医学工程系和公共健康研究中心，建立了基础医学、临床医学、生物医学工程和公共健康四大学科，两个一级学科生物学、生物医学工程。
三、科研成果：
1、北大医学部：北大医学部作为第一完成单位，共获得各级各类科技奖励157项。其中国家级科技奖励10项，省部级科技奖励44项。
2、协和医学院：学校承担各类科研项目共计4639项，其中承担国家级科研项目2869项，占项目总数的61.8%；累计获科研项目资助额达7.8亿。
3、清华医学院：学院开设了20多门高水平的专业基础课和专业课，其中5门课程建成“清华大学精品课程”。荣获北京市教学成果奖1项，清华大学教学成果奖6项。编写、出版了20多部教材和专著。
参考资料来源：百度百科—北大医学部
参考资料来源：百度百科—协和医学院
参考资料来源：百度百科—清华医学院