硼酸盐：硼酸盐与许多化合物形成复盐、如蔗糖。
柠檬酸盐：柠檬酸盐离子容易与钙结合，所以存在有钙离子的情况下不能使用。
磷酸盐：在有些实验，它是酶的抑止剂或甚至是一个代谢物，重金属易以磷酸盐的形式从溶液中沉淀出来。
而且它在pH7.5以上时缓冲能力很小。
三羟甲基氨基甲烷：它可以和重金属一起作用，但在有些系统中也起抑止的作用。
其主要缺点时温度效应。
这点往往被忽视，在室温pH是7.8的Tris一缓冲液，在4℃时是8.4，在37℃时是7.4，因此，4℃配制的缓冲液拿到37℃测量时，其氢离子浓度就增加了10倍。
而且它在pH7.5以下，缓冲能力很差。
缓冲液的pH值由哪些因素决定？设缓冲系统的弱酸的电离常数为K（平衡常数），平衡时弱酸的浓度为【酸】，弱酸盐的浓度为【盐】，则由弱酸的电离平衡式可得下式：根据此式可得出下列几点结论：（1）缓冲液的pH值与该酸的电离平衡常数K及盐和酸的浓度有关。
弱酸一定，但酸和盐的比例不同时，可以得到不同的pH值。
当酸和盐浓度相等时，溶液的pH值与PK值相同。
（2）酸和盐浓度等比例也增减时，溶液的pH值不便。
（3）酸和盐浓度相等时，缓冲液的缓冲效率为最高，比例相差越大，缓冲效率越低，一般地说缓冲液有效缓冲范围为PK±1pH。
从上述可知，只要知道缓冲对的PK值，和要配制的缓冲液的pH值（及要求的缓冲液总浓度）时，可按公式计算出【盐】和【酸】的量。
这样算涉及到对数的换算，较麻烦，前人为减少后人的计算麻烦，经计算已为我们总结出pH值与缓冲液对离子用量的关系列出了表格。
讲义附录部分节录有磷酸缓冲液的配制表。
只要我们知道要配制的缓冲液的pH，经查表便可计算处所用缓冲剂的比例和用量。
例如配制500nmpH5.8浓度为0.1M磷酸缓冲液。
经查表知pH5.8浓度为0.2M
Na2HPO48.0毫升，而0.2M
Na2HPO492.0毫升。
依此可推论出配制100ml0.1M的磷酸缓冲液需要0.1M
Na2HPO48.0毫升，而0.1M
Na2HPO4需要92.0毫升。
计算好后，按计算结果称好，放于烧杯中，加少量蒸馏水溶解，转移入50ml容量瓶，加蒸馏水至刻度，摇匀，便得所需的缓冲液。
各种缓冲溶液的配制，均按下表按比例混合，某些试剂，必须标定配成准确的浓度才能进行，如醋酸、NaOH等。