一、职位不同：
事业单位编制属于正式工作人员。
政府雇员，也就是通常意义上的临时工，也是有编制要求的。一个单位要增加临时工，也需要经过审批，增加临时工编制后才能聘用。政府雇员做得好，也必须经过政府统一组织的考试才能成为公务员或事业编制。
二、作用不同：
政府雇员制把市场用人机制引入政府机构，是提高行政效率的需要。还将会淡化政府机关的官本位色彩，打破政府机关只进不出的用人弊端。
事业编制就是指事业单位的人事编制。有些行政机关也有事业编制，主要是指司机、电工、炊事员、锅炉工等后勤人员，不属于公务员。
三、意义不同：
政府雇员指的是政府机关根据工作的特殊需要，从社会上雇用的法律、金融、经贸、城建、规划、信息、外语及高新技术等方面的专门人才。他们不占用行政编制，不具有行政职务，不行使行政权力，完全按契约化管理，只从事某项专业性工作。此外，雇员不执行公务员的工资标准，薪酬待遇相对较高。
事业编制是辅助编制，就是依靠政府单位的财力和权利成立的单位叫事业单位，用于增加政府单位的的财政收入，和辅助职能的行使。
扩展资料：
政府雇员招录制度：
出现“政府雇员”甚至“高级雇员”的现象，首先需要拷问的是我们的公务员招录制度。政府出台相关《办法》的理由非常明确：缺少法律、金融、经贸、城建、规划、信息、外语及高新技术等方面的专门人才。那么，年年都搞、规模渐大的“公务员招考”究竟都干了些什么？稀缺人才为什么无法通过“正常渠道”进入政府序列？
扬州市把“政府雇员”分为“普通雇员”和“高级雇员”。“普通雇员”须有本科以
上学历和3年以上专业工作经历，或有中级职称。“高级雇员”须是特殊的高级专才，有硕士、博士学位或高级职称，本专业领域有较高知名度和较大影响力，“而符合这些条件的公务员报考者并不鲜见。”该教授说。
该教授同时认为，扬州市要在全省率先全面推出“政府雇员制”，“全面”二字值得推敲——既然“雇员”的初衷是寻找“稀缺人才”，那么，少量的、短期的、项目型的、合作型的都可以考虑，而一旦“全面”了，便失去了制定政策的意义。
参考资料来源：百度百科-政府雇员