当此之时，铁道部管辖关内铁路营业干、支线共10733公里，职103486人，设路局11，警察署11，警察段和警察分段94，警察大、中队35，共有员警19410名。1938年1月，随着铁道部并入交通部，铁道队警总局改为交通部队警总局，除增设5个警备支队（共9个团）外，编制没有大的变化，直至在日本侵华战争中瓦解。
1946年4月交通警察总局重新成立之后，援照战前的编制，迅速恢复了铁路警察系统，组织上较前更为充实。
（1）交通警察总局，设局长1人，副局长2人，专员4人，内设三室五处十六科，编制273人。另有十八个交通警察总队，作为机动部队分驻铁路、公路及水上交通要点执行巡护任务，由交警总局直接指挥。该局内设机构为：
秘书室，掌理机要、编译文书计划及法规事项；
人事室，承办人事统计及任免事项；
会计室，承办经费概算、决算、核编、费用审核及其他财务事项；
第一处，掌理警察部队调遣部署及一切行政事项；
第二处，掌理警察部队督察及整训事项；
第三处，掌理违章违法案件侦察处理事项；
第四处，掌理经费、粮袜、被服、枪械、装具器材事项；
第五处，掌理总务、卫生医药及不属各处室的事项（注：当时的警察掌管卫生防疫事项）。
（2）交通警察总局在铁路局所在地均设警务处，称“交通部XX铁路管理局警务处”。警务处内设三课一室，即管理课、警事课、司法课及督察室。另设警察教练所、拘留所、警察大队和消防队，作为警务处直属机构。
（3）各警务处在管辖线路按区段设置警务段。警务段内设管理、警事、司法、督察四股，其职掌与警务处的三课一室相同。另设有拘留所，由司法股管理。每个警务段之下，设三个警务分段，协助警务办理列管事宜。警务分段在管段之内，每两、三个或四、五个车站设一个警察分驻所，分驻所编制30至90人不等。分驻所在所辖车站设派出所（属于勤务单位，相当现在的驻站组）。从实际情况看，几乎站站都有警察机构。以平津警务处为例，管辖线路1470公里，设警务段12，分驻所61，派出所93，另有2个警察大队6个中队分别在沿线担当巡防任务，警察实编5245人。
到解放前夕，第一交警总局在关内的平津、津浦、陇海、平汉、晋冀、粤汉、京沪杭、浙赣、川滇滇越、昆明铁路局、湘桂黔、成渝铁路工程局，共设12个警务处；第二交警总局在东北的锦州、沈阳、吉林、齐齐哈尔铁路局，共设4个警务处，并在长春设有铁路警察局。
1949年铁道部成立公安局之初，局内设秘书、人事、调查、保卫、治安、警卫、警政、直属工作等8个课，侦察、保卫两个队和看守所，共130余人。1953年将内设机构改为一室五处一部，编制150余人。1954年并入公安部十局后，改为八处三室，编制290余人。后逐年减编，到1965年，实编113人。
1975年，交通、铁道两部分开，重新成立铁道部公安局后，逐步加强，到70年代末编制增至109人。1982年后又逐步减员，到1993年“三定”，机构调整为十处一室一部，即：侦察保卫处、法制监管处、治安消防处、警卫处、刑事侦察处、综合技术处、机关保卫处、组织处、宣传处、教育处、办公室、政治部，定员73人。
在铁道部公安局以下，依附铁路管理机构的设置设有三级公安机构。即：运营系统在铁路局、铁路分局所在地分别设立铁路公安局和铁路公安处，三等以上车站设置公安派出所；工程系统在工程、建筑两个总公司分设工程公安局和建筑公安局，在各工程局设公安处，在施工现场设公安派出所，有些民警多、任务重的工程局在工程处一层设公安分处或公安段，协助公安处管理队伍，推动工作。现在，全路共有6万6千公里运营铁路，约4700公里建设铁路，设有哈尔滨、沈阳、北京、济南、上海、郑州、南昌、广州、柳州、昆明、成都、兰州、呼和浩特、乌鲁木齐、青藏、武汉以及太原、西安共18个公安局，95个公安处（其中工程、建筑系统23），1890个公安派出所，79个乘警队，84个看守所，共有民警72000余人。此外，铁道部还设有公安管理干部学院1所，各铁路局设中等公安学校9所。
最后要提一点：铁路公安现已属于国家公务员编制。他们的业务由公安部统一管理，警衔的评定（按不同的级别）分别由公安部（或各省市自治区公安厅）审核。他们与森林、机场、海关等公安一同属于专业警察编制。由于铁路遗留的历史问题,曾经的铁路检察院、铁路法院同属于专业铁路公检法序列。但因为铁路体制的大改革，现已将铁路学校、铁路医院、铁通剥离铁路，回归地方管理，铁路公检法也已随铁路改革及大交通部改革等剥离出来，隶属地方。当然归公安部管理的，只不过是垂直管理，和地方没有关系应该是双重领导，就像公安局既归当地政府领导，也归上级公安部门领导。
铁道部公安总局（正厅级行政单位）正式成立于2001年9月，依次下辖的公安单位有：直属机构、各铁路局公安局（正局级集团公司 如：广铁集团公安局）公安局、各铁路分局公安处（副局级铁路公司 如：广铁集团怀化铁路总公司公安处）、三等车站以上的铁路公安派出所（如：深圳铁路公安处东莞车站铁路派出所）看守所、监狱管理所、三等车站以下设立的车站警务区（室）。
