华侨大学福建音乐学院的专业设置丰富多样，主要涵盖本科和大专层次教育。其中，本科专业包括音乐表演，这个专业设有四个方向：演唱、键盘乐器演奏、管弦乐器演奏和民族乐器演奏。这些专业课程采用一对一的教学模式，确保每个学生都能得到个性化指导，教学计划严谨，管理规范，旨在培养具备全面知识、技能和素质的综合应用型音乐人才。
此外，音乐学专业也设有本科选项，除了常规的音乐教育课程，还增加了教育学、心理学、正音、舞蹈以及音乐教材教法等课程，旨在提升学生的教育理论素养和实践能力，为培养具有扎实音乐基础和教育技能的合格音乐教师和社会应用型人才打下坚实基础。无论是专业表演还是教育方向，福建音乐学院都致力于为学生提供全面而专业的教育，以满足不同领域的需求。
福建音乐学院创办于1994年3月，是由爱国华侨、国际著名音乐家、校祖蔡继琨教授兴办的民办高等音乐院校。2000年经教育部和福建省人民政府批准，以相对独立挂靠华侨大学成立华侨大学福建音乐学院（独立学院），实施本、专科教育，面向境内外招生。