根据2016年3月研究所官网显示，中国农业科学院烟草研究所有在职职工206人，离退休人员141人。在职人员中，专业技术人员168人，45岁以下专业技术人员119人，占专业技术人员总数的71%。正高职称专家29人，副高职称专家54人，中级职称62人。具有博士学位49人，硕士学位66人，硕士以上学历占在职职工的50%以上。博士、硕士生导师51人，博士后研究人员4人。享受国务院政府特殊津贴17人，农业部有突出贡献的中青年专家2人，烟草行业学科带头人2人，中国农业科学院青年英才计划入选者2人，国家公益性行业专项首席科学家1人，中国农业科学院科技创新团队首席科学家6人。
农业部有突出贡献的中青年专家：王元英、刘洪祥
国家公益性行业专项首席科学家：王元英
烟草行业学科带头人：王元英、刘洪祥
中国农业科学院科技创新团队首席科学家：王树声、王元英、郭永峰、孔凡玉、张忠锋、王凤龙
中国农业科学院青年英才计划入选者：孔英珍等
高级专家： 高级专家 类别姓名正高级专家 王元英、王树声、王凤龙、梁洪波、王志德、孙福山、刘好宝、管辉、王允白、李毅君、孙玉合、石屹、徐宜民、张忠锋、冯全福、钱玉梅、时焦、孔凡玉、申国明、刘贯山、郭承芳、陈刚、罗成刚、郭永峰、徐秀红、孔英珍、杜咏梅 副高级专家 丁昌敏、孙希芳、张怀宝、徐秋萍、商耀、刘新民、刘伟、章启发、张连、张文丽、付宪奎、戴培刚、任广伟、许立峰、窦玉青、邱军、陈志强、梁晓芳、李义强、冀永清、张久权、吴洁、陈德鑫、杨爱国、董建新、刘艳华、常爱霞、王传义、王静、张成省、王绍美、任民、王卫锋、马兴华、申莉莉、刘少云、龚达平、李凤霞、陈爱国、孙惠青、王新伟、杨金广、迟立鹏、宋志美、王倩、张继光、王秀芳、王秀国、曹鹏云 资料来源： 根据2016年3月研究所官网显示，中国农业科学院烟草研究所设有8个科研部门，有农业部重点实验室2个，烟草行业重点实验室2个，中国农业科学院重点开放实验室1个，中国农业科学重点科技创新团队2个，6支所级科研创新团队。
农业部重点实验室：农业部烟草生物学与加工重点实验室、农业部烟草质量安全风险评估实验室
烟草行业重点实验室：烟草行业烟草基因资源利用重点实验室、烟草行业烟草病虫害监测与综合治理重点实验室
中国农业科学院重点开放实验室：中国农业科学院烟草遗传改良与生物技术重点开放实验室
中国农业科学重点科技创新团队： 名称负责人烟草遗传育种创新团队王元英烟草栽培营养与调制加工创新团队王树声资料来源： 所级科研团队：烟草遗传育种科研团队、烟草功能基因组科研团队、烟草栽培与调制科研团队、烟草质量安全风险评估科研团队、烟草功能成分与综合利用研究科研团队、烟草病虫害防控科研团队 馆藏资源 根据2016年3月研究所官网显示，中国农业科学院烟草研究所馆藏图书、资料、期刊共60000余册（部），保存烟草种质资源5300多份，独家保存量居世界首位。 仪器设备 根据2016年3月研究所官网显示，中国农业科学院烟草研究所专用科研仪器设备1300余台（套）。 有科研、实验用房（楼）等总建筑面积40000余平方米，专用科研仪器设备1300余台（套），试验用地73.6公顷。其中，青州试验基地27.6公顷，青岛试验基地31.4公顷，西昌试验基地14.6公顷。
截至2015年12月，农业部烟草生物学与加工重点实验室仪器设备总值1320万元，其中10万元以上大型仪器设备总值1044万元。 农业部烟草质量安全风险评估实验室（青岛）配备有气质联用仪、液质联用仪、电感耦合等离子质谱仪等仪器设备100余台（套）。 烟草行业烟草基因资源利用重点实验室有遗传分析仪、荧光定量PCR仪、高速离心机、生物倒置显微镜等仪器设备，价值1448.5万元，其中10万元以上设备40余台（套），价值1250万元。 烟草行业烟草病虫害监测与综合治理重点实验室有全温震荡培养箱、自动进样仪等仪器6台套，价值20万元。 国家烟草改良中心有液质联用仪、ICP-MS、基因分析仪、蛋白质双向电泳仪、生物信息学分析平台、人工气候室、超速离心机、超低温冰箱、细胞 融合仪、紫外分光光度计、酶标仪、荧光定量PCR仪、凝胶扫描仪、遗传分析系统、生物显微镜、倒置生物显微镜、高效生物层析系统等仪器设备400余台 （套），价值3000余万元。
