在自己宅基地上盖两层不属于违建。在一般情况下，只要符合相关规划和建设规定，经过合法审批程序，并在建设过程中遵守相关规定，就不属于违建。
首先，我们需要明确宅基地的定义。宅基地是农村村民用于建造住宅及其附属设施的集体建设用地，包括住房、附属用房和庭院等用地。因此，在宅基地上建造两层楼房并不违反其用途。
其次，关于建筑是否违建，主要取决于是否违反了当地的土地利用规划、城乡规划和建设管理等相关法规。如果两层楼房的建设符合当地的规划要求，且已经获得了必要的建设许可，那么它就是合法的。
例如，在某些地区，村民在宅基地上建房需要先向村委会或乡镇政府提交申请，经过审批并获得建设许可证后才能开始施工。如果两层楼房的建设符合这些程序，那么它就是合法的。
此外，即使在自己的宅基地上建房，也需要遵守相关的建设规定，如建筑高度、建筑面积、建筑密度、消防安全等方面的规定。如果两层楼房的建设违反了这些规定，那么可能会被认为是违建。
因此，建议在开始建设之前，先了解当地的相关政策和规定，确保自己的建设行为合法合规。如果遇到不确定的情况，可以咨询当地相关部门或专业人士的意见。
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