他由普陀山回到宁波，行脚到金陵，投入宝华山剃度出家。时为光绪三十一年（1905年），他年二十五岁。在宝华山剃度后，因受不了寺僧对他的折磨，乃逃离寺院，到得江边，在一个草棚中与野犬为伍，采食野果充饥。困顿多日，欲投江死，幸为人所救，送他到京口弥陀寺，休养了一段时间，光绪三十三年（1907年）春，闻得金山江天寺开坛传戒，欲待赶往金山受戒。往金山时，途经南茅山，山有朝阳洞，闻人云∶“朝阳洞中有碟子大一块天。”他欲一探究竟，找到朝阳洞，攀缘而下，洞深约五丈，下为平地，伸手不见五指，而广大无涯。他前行约一里许，双手摸得一块石头，乃放下浦团，盘膝打坐，不知过了多久，忽有月光照入，洞内景色晃然清朗。茫然四顾间，忽闻水声如雷，于是急负物起身，出得洞后，遇到人问今日几时，人答曰∶“二月三十。”他记得他是二月二十三动身，何以下了一次洞就到了月底，难道当真像古人所说“洞中方七日，人间已三年”吗？匆匆赶到金山，参加受戒，之后留在寺中随众参禅，单参“念佛者是谁”一句话头，以悟为期，不悟誓不出禅堂。由于他不熟悉禅堂规矩，曾有一日被击香板百余次的记录。惟他道心猛勇，绝不退悔，光绪三十四年（1908年）的九月二十六日，在禅堂中坐香，晚六枝香开静声响，猛然豁落，千斤重担放下，顿觉云空川流，碍滞全消，他开悟了。
一日，慈本老和尚举手巾作洗脸的姿势，问他∶“这是什么？”
来果答∶“多了一条手巾。”老和尚不答而退，来果自是也益为仔细谨慎。他在金山一住数年，其间曾充任饭头，力事撙节，极有成效。首座见他有才干，劝他任班首，他自度学浅，一再辞谢。离开金山，曾去朝礼过五台山，也曾到印度朝礼圣迹。赴印途中，经过湖北，他昼夜兼程，赶回黄冈家乡，去探视他老年的父亲。他的一身装扮，仍是头戴一凉蓬，身穿一衲袄，方便铲，圆蒲团，一瓢一筷，不带其他杂物。
在《来果禅师异行录》中，记载有他回家度化他父亲的情形∶
“午夜兼程，拟将父亲化回，皈依三宝，以满我愿。将到家庙门口，与父相值，寒暄後，一同回家，既至，诚劝父云∶‘韶光虚度，数十年如一瞬，我父前途，路有多少，还有几天光阴可过呢？’父不觉泪下不止，遂倾心皈依三宝。”
