珍珠奶茶中的“珍珠”其实是淀粉为主要原料制成的粉圆产品，常用的木薯淀粉是一种。
除此之外，为了有好的口感和嚼劲，还会用一些小麦蛋白和食品添加剂。小麦蛋白是一种蛋白质，除了某些对小麦过敏的人，小麦蛋白不会对人体构成任何危害。
珍珠奶茶中的珍珠对人体无害。所有淀粉食物进入消化道后会产生糊精，糊精是淀粉不完全水解得到的降解产物。我们平时吃饭、吃面包等含淀粉的食物，进入消化道后也逐渐分解糊精、再分解成葡萄糖才能被人体吸收。
而珍珠是否会造成肠梗阻，这跟消费者的胃肠吸收功能和所食物品都有关系。本身胃肠功能不太好的人群，如幼儿和老年人，喝大量的珍珠奶茶还是有风险的。若大量吞食珍珠奶茶中的珍珠，不仅容易造成胃排空不通畅，也会有吸入器官中的危险。因此，在饮食时应该细嚼慢咽，尤其像珍珠粉圆等食物。
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另外，有许多店家以咖啡冻、豆花、布丁、仙草、等类似口感的食物添加进奶茶里，让客人自由选择以增加口感。
至于“珍珠”，一般使用较大颗粒的粉圆，烹煮后的直径约7mm以上，否则粉圆太小，用一般口径大的茶饮吸管时容易变得“满嘴珍珠”，也不方便品尝圆润香Q的咬劲。
有一阵，南台湾将使用大颗粒粉圆的珍珠奶茶称为“波霸奶茶”，而用小颗粉圆的称为“珍珠奶茶”。但在北台湾，珍奶店通常只卖“珍珠奶茶”，都使用大颗粉圆，后来变成了全岛统一的通称和规格。
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