2010年初，野生动植物保护国际组织在缅甸克钦邦东北部进行灵长类动物调查时，收集到一具完整的仰鼻猴尸体标本。经比较，科研人员兴奋地判断，新物种不同于任何已知灵长类，是一新种金丝猴，并于2010年10月26日在《美国灵长类动物学杂志》上发表了这一成果。为纪念阿克思基金会（致力于世界野生猿类研究）的创始人乔恩·斯瑞克，并感谢他对缅甸灵长类调查项目的支持，将新种拉丁名定为Rhinopithecus Stryker。由于这一物种模式标本发现地在缅甸，故又俗称“缅甸金丝猴”。
鉴于缅甸金丝猴发现地点离中国云南怒江州泸水县直线距离不超过50公里，怒江州林业局积极着手组织人员寻访。2010年10月26日，中国灵长类专家组组长龙勇诚首次收到《美国灵长类学报》有关缅甸克钦邦东北部发现金丝猴新种描述文章的审阅稿，便立即与怒江州林业局共商在怒江找寻这一金丝猴新种的可能性，在科学分析的基础上，怒江州林业局迅速组织精干力量，安排专项经费，启动了金丝猴新种的野外调查工作。
2011年10月16日，经过近一年不懈的走访调查和野外蹲守，高黎贡山国家级自然保护区泸水管理局片马保护站森管员六普在高黎贡山自然保护区泸水段48号界桩附近拍摄到一组黑色猴子野外生存照片。林业部门技术人员将其与野生动植物保护国际（FFI）公布的金丝猴新种模式标本照片进行了对比后认为相似度极高。中国灵长类专家组组长龙勇诚等专家对这组疑似金丝猴新种的照片进行鉴定后确定，这是人类首次采集到这一物种的野外生存照片，明确了怒江州属于金丝猴新种的重要分布区。通过对比金丝猴与其他灵长类动物的特征，证实这只猴子与在缅甸发现的新种金丝猴属同一个种。由此也证明了，云南存在世界上的第五种金丝猴。
发现金丝猴新种群后，怒江州林业部门开展了走访调查，发现这种金丝猴为怒江当地世居猴群，很早以前就有村民见到过。这种金丝猴在当地傈僳语中被称为“猕阿”，意为鼻孔朝天的猴子。因为它们体毛呈黑色，一些群众又称其为“黑猴子”。
2011年10月16日清晨，森管员六普在高黎贡山自然保护区泸水段49号界桩附近，第一次用自动相机清晰拍摄到怒江金丝猴野外生存图片：它们全身毛发只有脸部、胸部和会阴部呈白色，其他部分都是黑色。2012年3月14日，六普在泸水段48号界桩附近，又第一次清晰拍摄到怒江金丝猴野外生存影像。这一次他们不仅拍摄到了金丝猴活动的照片和视频，并采集到粪便2份和采食植物若干份。提取到的粪便样本，经中国科学院昆明动物研究所DNA鉴定，首次在分子水平上肯定了怒江金丝猴作为世界第五种金丝猴在中国的存在。此次拍摄到的视频资料也尤为珍贵，是世界上首次记录怒江金丝猴在野生状态下的影像资料。
2012年4月9日，中国科学院昆明动物研究所和云南大学对怒江金丝猴粪便进行的DNA检验结果显示：怒江金丝猴与滇金丝猴有亲缘关系，它们的DNA相似度为96.7%。怒江金丝猴的基因序列与世界上已发现的川金丝猴、滇金丝猴、黔金丝猴、越南金丝猴等4个金丝猴物种不一样。生物学界第一次从分子水平上确定中国境内发现了新的金丝猴物种。
科学家在缅甸发现这种金丝猴时，就已经命名了拉丁名，这是不能更改的。2011年10月16日，在高黎贡山国家级自然保护区怒江州泸水片区，中国基层的林业工作者首次拍摄到世界上首张金丝猴新种活体照片，证实了其在中国境内的确实分布，中国灵长类专家组将其中文命名为“怒江金丝猴”。2012年10月，黑色仰鼻猴新种在中国怒江州发现的科学文章在《美国灵长类学报》正式发表，其中文名正式定为“怒江金丝猴”。
怒江州是中国唯一拥有两种金丝猴的地区，即：怒江金丝猴和滇金丝猴。从此以后，云南就不仅仅有滇金丝猴了，还多了一种金丝猴——“怒江金丝猴”。
