社会主义初级阶段的科学含义是指我国社会已经是社会主义社会，但仍然处于社会主义的不发达阶段。
这一判断包括两层涵义：一是我国已经进入社会主义社会，我们必须坚持而不能离开社会主义；二是我国的社会主义还处于初级阶段，我们必须正视而不能超越这个初级阶段。这两层涵义既相对独立，又相互依存，统一于我国社会主义初级阶段的实践。
我国社会已经是社会主义社会，这是对我国社会的根本性质所作的科学判断。它表明，我国社会中占统治地位的生产资料公有制、人民当家作主的政治制度、马克思主义的指导思想和以集体主义为原则的社会主义意识形态等，已经决定了我国社会的根本性质是社会主义的。但是，我国社会主义还处在初级阶段，这是对我国社会发展程度的科学判断。它表明，我国社会生产力还比较落后，多数地区、多数行业还没有摆脱不发达的状态；社会主义制度还不完善，社会主义市场经济体制还不成熟，社会主义民主法制还不够健全，封建主义、资本主义腐朽思想和小生产习惯势力在社会上还有广泛的影响。
总的来说，社会主义初级阶段的科学含义是指我国在社会主义制度建立后，仍然需要经历一个相对较长的初级阶段，以逐步实现社会主义现代化。这个阶段的特点是不发达，需要通过改革开放和现代化建设来推动社会生产力的发展，提高人民生活水平，完善社会主义制度。同时，这个阶段也是充满机遇和挑战的阶段，需要我们在实践中不断探索和创新，为实现中华民族伟大复兴的中国梦而努力奋斗。